DiamondLightSource/httomo

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High-throughput tomography pipeline

Stelle: 10
Fork: 5
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 116
Merge medio: 5g 17h
PR unite (30g): 1

Lingua principale: Python
Licenza: Nessun dato sulla licenza
Ultimo push su GitHub: 27/8/2026
Ultima indicizzazione: 15/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

116 issue aperte indicizzate

Creating pipelines zip archive in docs CI on every push to a PR branch Aperta

ci

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 88/100

DiamondLightSource/httomo#714 · Aperta il 22/4/2026
Revisit if halving of `--max-memory` value is appropriate Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

DiamondLightSource/httomo#707 · Aperta il 7/4/2026
Failing `save_intermediate_data` method MPI tests Aperta

testing

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

DiamondLightSource/httomo#705 · 1 commento · Aperta il 2/4/2026
Multiple tmp dirs created but only one used for file-backed dataset store Aperta

framework minor

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100

DiamondLightSource/httomo#699 · Aperta il 30/3/2026
Unnecessary `docs/index.html` file? Aperta

documentation question

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100

DiamondLightSource/httomo#697 · Aperta il 26/3/2026
Function determining dataset store backing incorrectly assumes new numpy array is always created by reader Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 68/100

DiamondLightSource/httomo#693 · Aperta il 24/3/2026
Fragmentation of the global CuPy memory pool Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

DiamondLightSource/httomo#667 · Aperta il 18/12/2025
Redundant logging of GPU ID in data transfer method Aperta

logging minor

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#658 · Aperta il 5/12/2025
`DataSetBlock` constructor takes some params with padding applied but also takes in the padding value Aperta

framework refactor

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

DiamondLightSource/httomo#645 · Aperta il 24/10/2025
Document that block splitter doesn't know about padding when reading blocks Aperta

documentation framework

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#642 · Aperta il 20/10/2025
OutputRef cannot be accessed in a method when padding Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

DiamondLightSource/httomo#632 · Aperta il 2/10/2025
Incorrect type of `start_offset` and `stop_offset` keys in `StartStopEntry` Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#611 · Aperta il 28/7/2025
Incorrect type of `start` and `stop` keys in `StartStopEntry` Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 58/100

DiamondLightSource/httomo#610 · Aperta il 28/7/2025
Incorrect type of key in `StartStopEntry` for representing a key that may not be present Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 72/100

DiamondLightSource/httomo#609 · Aperta il 25/7/2025
Incorrect type of key in `PreviewParam` for representing a key that may not be present Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 52/100

DiamondLightSource/httomo#608 · Aperta il 25/7/2025
Inappropriate tuple-like type for `UserDefinedAngles` Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 62/100

DiamondLightSource/httomo#607 · Aperta il 25/7/2025
Inappropriate tuple-like type for `RawAngles` Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 52/100

DiamondLightSource/httomo#606 · Aperta il 25/7/2025
Add ignoring a specific subset of darks and/or flats feature to `StandardTomoLoader` Aperta

enhancement loader

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

DiamondLightSource/httomo#603 · Aperta il 24/7/2025
Handle numpy `_ArrayMemoryError` in reslice `np.concatenate()` call to avoid deadlock in multi-process runs Aperta

bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

DiamondLightSource/httomo#602 · 3 commenti · Aperta il 17/7/2025
Include MPI process rank in exception log messages Aperta

logging minor

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#601 · Aperta il 17/7/2025
Validate fields given in `preview` loader parameter Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

DiamondLightSource/httomo#597 · Aperta il 4/6/2025
Some UI layer tests take longer than expected to run Aperta

testing

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100

DiamondLightSource/httomo#593 · Aperta il 28/5/2025
Failing conda env creation command in installation docs Aperta

bug documentation

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 48/100

DiamondLightSource/httomo#591 · 2 commenti · Aperta il 20/5/2025
Pascal case instance attribute in `UiLayer` Aperta

minor

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 58/100

DiamondLightSource/httomo#589 · Aperta il 15/5/2025
Document pipeline transformations applied by `UiLayer` Aperta

documentation

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100

DiamondLightSource/httomo#585 · Aperta il 15/5/2025
UI layer test name lacks information on what it's testing Aperta

testing

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#584 · Aperta il 15/5/2025
Out of date mention of python pipelines in `UiLayer` docstring Aperta

documentation

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 65/100

DiamondLightSource/httomo#582 · Aperta il 12/5/2025
Inconsistent creation of blocks by test loader compared to real loader Aperta

testing

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#579 · Aperta il 8/5/2025
Code block not rendered in docs Aperta

documentation

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiamondLightSource/httomo#576 · Aperta il 28/4/2025
Consider removing unused plumbum dependency Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

DiamondLightSource/httomo#568 · Aperta il 9/4/2025
Some framework tests require tomopy Aperta

testing

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

DiamondLightSource/httomo#565 · 1 commento · Aperta il 3/4/2025
Unnecessary `typing_extensions` dev dependency Aperta

packaging

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 38/100

DiamondLightSource/httomo#563 · Aperta il 27/3/2025
Pyright error if `import httomo` used instead of `import httomo.globals` Aperta

minor

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

DiamondLightSource/httomo#561 · Aperta il 21/3/2025
preview is smaller than the padded data Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiamondLightSource/httomo#548 · Aperta il 17/2/2025
Document method wrappers which transform the `auto` value for a parameter Aperta

documentation

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100

DiamondLightSource/httomo#547 · Aperta il 17/2/2025
Unnecessary setting of `parameters["in_file"]` in `UiLayer._setup_loader()` Aperta

minor

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#546 · Aperta il 17/2/2025
Loader factory function doesn't use `MethodRepository` or `module_path` params Aperta

loader

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

DiamondLightSource/httomo#533 · Aperta il 11/12/2024
Old preview syntax in testing pipeline Aperta

minor

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#525 · Aperta il 6/11/2024
YAML with a colon but no space is valid YAML, but produces a string instead of a map Aperta

question

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

DiamondLightSource/httomo#524 · 1 commento · Aperta il 6/11/2024
fixing versions for dependencies Aperta

question

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 32/100

DiamondLightSource/httomo#518 · 1 commento · Aperta il 29/10/2024
Potentially confusing print by YAML checker when checking a loader is first in the pipeline Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#515 · Aperta il 28/10/2024
Revaluate whether `StandardLoaderWrapper` is needed or not Aperta

loader refactor

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

DiamondLightSource/httomo#504 · Aperta il 21/10/2024
Sort out inconsistencies and oddities with the loader's YAML template and how a loader is referenced in a pipeline file Aperta

loader refactor

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

DiamondLightSource/httomo#501 · 1 reazione · Aperta il 21/10/2024
Inconsistent docstring format across codebase Aperta

documentation

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiamondLightSource/httomo#499 · 1 commento · Aperta il 18/10/2024
`cufft.py` module excluded from API docs Aperta

documentation memory-estimation

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

DiamondLightSource/httomo#498 · Aperta il 18/10/2024
Sphinx docs build in CI produces warning due to import error when importing `httomo.cli` module Aperta

ci documentation

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

DiamondLightSource/httomo#495 · 1 commento · Aperta il 17/10/2024
Unnecessary `nvtx` dependency Aperta

minor

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 55/100

DiamondLightSource/httomo#493 · Aperta il 16/10/2024
Combining `|` and `xp.ndarray` in a type causes warning in sphinx API docs build Aperta

bug documentation

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

DiamondLightSource/httomo#492 · 2 commenti · Aperta il 16/10/2024
Unnecessary list of one element per iteration in loop in YAML checker? Aperta

question refactor

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

DiamondLightSource/httomo#477 · Aperta il 11/10/2024
Methods without a `side_outputs` field may be unnecessarily included in `method_id_map` Aperta

question refactor

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

DiamondLightSource/httomo#475 · Aperta il 10/10/2024

DiamondLightSource/httomo

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