Can geno() obtain the reference depth and alternate allele separately?
Ninguém assumiu esta issue ainda.
Avaliação
- Dificuldade
- 5/5
- Tempo estimado
- Mais de uma semana
- Facilidade para iniciantes
- 15/100
- Tipo de issue
- Funcionalidade
- Clareza
- Precisa de esclarecimento
- Status de atividade
- Estagnada
- Stack de tecnologia
- r
- Domínio
- bioinformatics
Direção de pesquisa
Comece localizando o ponto de entrada geno() e lendo como as informações de genótipo são expostas atualmente. A issue não fornece detalhes sobre arquivo, testes ou critérios de aceitação; portanto, esclareça o comportamento esperado para a profundidade de referência e o alelo alternativo antes de alterar qualquer coisa. O trabalho estará concluído quando os dois valores puderem ser obtidos separadamente, com cobertura correspondente nos testes do pacote.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
Esta issue não tem descrição.
- Linguagem predominante
- R
- Estrelas
- 32
- Forks
- 21
- Métricas de merge de PRs
- Nenhum PR com merge em 30d
Preparar o ambiente
Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
Mais de Bioconductor/VariantAnnotation
-
refactor the packageAberta
Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100
Bioconductor/VariantAnnotation#115 · 4 comentários ·
-
what is the "covr" condition of this package?Talvez já em andamento @vjcitn assumiu há 94 dias. Aberta
Bioconductor/VariantAnnotation#114 · 1 reação · 2 responsáveis ·
-
produce false positive and false negative PRsTalvez já em andamento @jmg421 assumiu há 84 dias. Aberta
Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 35/100
Bioconductor/VariantAnnotation#113 · 2 comentários ·
-
possible problem parsing INFO description fieldTalvez já em andamento @jmg421 assumiu há 116 dias. Aberta
Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100
-
Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 30/100
Bioconductor/VariantAnnotation#88 · 2 comentários ·
Todas as issues de Bioconductor/VariantAnnotation
Issues semelhantes
-
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 72/100
rstudio/reticulate#1933 ·
-
Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 62/100
-
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 66/100
Mantenedores costumam responder em até 1 dia
-
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100
lrberge/fixest#686 · 2 comentários ·
Mantenedores costumam responder em até 1 dia
-
Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 82/100