Perf: coordinate-only projections skip pushdown, so every data variable is still loaded
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評価
- 難易度
- 2/5
- 見積もり時間
- 1〜3時間
- 初心者へのやさしさ
- 72/100
- issue の種類
- リファクタリング
- 明瞭さ
- 明確に書かれている
- 活発さ
- 静か
調査の方向性
pushdown を判定する述語は src/lib.rs の PrunableStreamingTable::scan() にあります(607〜614行目付近)。read_xarray_table の対応する factory の分岐と、iter_record_batches のデータ変数がない場合の分岐を読み、その後で再現コードの呼び出し回数を確認してください。SELECT lat, lon が None ではない projection を factory に渡し、データ変数のチャンクを読まず、projection なしのスキャンと一致するバッチを返し、それを新しいテストで確認できれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Problem
PrunableStreamingTable::scan() only pushes the projection down to the Python partition factory when the projection contains at least one data variable. A projection made purely of dimension coordinates falls through to the non-pushdown branch, the factory is called with None, and every data variable in every scanned partition is loaded from storage before ProjectionExec throws it away.
src/lib.rs (main @ 5d7633e, lines 607 to 614):
// - projection contains only dimension columns (ds.to_dataframe()
// needs at least one data variable; dimensions are always loaded)
let push_projection = match projection {
Some(indices) if !indices.is_empty() => indices
.iter()
.any(|&i| !self.dimension_columns.contains(self.schema.field(i).name())),
_ => false,
};
The reason given in that comment no longer holds. The factory built by read_xarray_table already handles a coordinate-only projection explicitly:
if data_vars_needed:
ds_block = ds[data_vars_needed].isel(block)
else:
# Only dimension coords requested - drop all data vars to avoid
# loading them unnecessarily (e.g. for queries like SELECT lat, lon).
ds_block = ds.drop_vars(list(ds.data_vars)).isel(block)
and iter_record_batches has a matching if ds.data_vars: ... else: ... branch that takes its shape from ds.sizes when the Dataset has no data variables. So the Python side is ready for this case; only the Rust predicate keeps it unreachable.
Reproducer
Counts real data-variable chunk reads with a dask.array.map_blocks counter, and records the projection the factory receives.
import dask, dask.array as da, numpy as np, pandas as pd, xarray as xr
from datafusion import SessionContext
from xarray_sql import read_xarray_table
dask.config.set(scheduler="synchronous")
loads = {"n": 0}
def block(block_info=None):
loads["n"] += 1 # one call == one data-var chunk read
return np.zeros(block_info[None]["chunk-shape"], dtype="float32")
ds = xr.Dataset(
{
name: (("time", "lat", "lon"),
da.map_blocks(block, dtype="float32",
chunks=((10,) * 4, (20,), (30,))))
for name in ("air", "hum")
},
coords={"time": pd.date_range("2000-01-01", periods=40),
"lat": np.linspace(-90, 90, 20),
"lon": np.linspace(0, 359, 30)},
)
seen = []
ctx = SessionContext()
ctx.register_table("t", read_xarray_table(
ds, {"time": 10}, _iteration_callback=lambda blk, proj: seen.append(proj)))
for sql in ("SELECT COUNT(*) c FROM t",
"SELECT lat, air FROM t",
"SELECT DISTINCT lat FROM t",
"SELECT lat, lon FROM t"):
loads["n"], seen[:] = 0, []
ctx.sql(sql).to_pandas()
proj = str(seen[0]) if seen else "(no scan)"
print(f"{sql:28} projection={proj:22} chunks_loaded={loads['n']}")
Output on main (4 partitions, 2 data variables):
SELECT COUNT(*) c FROM t projection=(no scan) chunks_loaded=0
SELECT lat, air FROM t projection=['lat', 'air'] chunks_loaded=4
SELECT DISTINCT lat FROM t projection=None chunks_loaded=8
SELECT lat, lon FROM t projection=None chunks_loaded=8
SELECT lat, air is correct: pushdown happens and only air is read, 4 chunks. The two coordinate-only queries read 8 chunks, both data variables across all four partitions, for an answer that needs zero data-variable bytes.
Impact
Any query answered entirely from the coordinate axes still pays for the full data payload:
SELECT DISTINCT time FROM dsorSELECT DISTINCT level FROM dsto discover what an axis containsSELECT lat, lon FROM ds WHERE ...to fetch a grid outlineCOUNT(DISTINCT lat)- any front end populating filter widgets from the dimension coordinates
On a local NetCDF this is a wasted copy. On a remote Zarr store it is a chunk fetch per data variable per partition. The waste also scales with the number of data variables in the table, which the same-dimensions grouping in from_dataset makes the common case.
Proposed fix
Push the projection whenever it is Some and non-empty, dropping the "contains at least one data variable" condition, and update the comment. The non-pushdown branch stays for None and Some([]).
I checked the Python half directly rather than assuming it: feeding iter_record_batches a block with drop_vars(list(ds.data_vars)) and a coords-only pa.schema returns the right row count and columns, so the projected path looks ready for this. I have not built the Rust change yet, so the predicate edit still needs compiling and testing.
Worth adding a test that asserts the factory receives the coordinate-only projection and that the resulting batches match the unprojected scan.
Parent: #126
- 主要言語
- Python
- スター
- 142
- フォーク
- 19
- 平均マージ
- 1日 9時間
- マージ済み PR(30日)
- 9
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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