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talmolab

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索引済みのリポジトリ 22 件 · GitHub で見る

sleap
A deep learning framework for multi-animal pose tracking.

Python · スター 618 個
stac-mjx
Implementation of STAC using MJX for GPU acceleration. Part of VNL project.

Jupyter Notebook · スター 26 個
sleap-io
Standalone utilities for SLEAP pose tracking data.

Python · スター 24 個
sleap-nn
Neural network backend for training and inference for animal pose estimation.

Python · スター 21 個
dreem
DREEM Relates Every Entities' Motion (DREEM). Global Tracking Transformers for biological multi-object tracking.

Python · スター 19 個
track-mjx

Jupyter Notebook · スター 16 個
sleap-roots
Analysis tools for SLEAP-based plant root phenotyping.

Python · スター 14 個
vnl-playground
Virtual Neuro Lab (VNL). Deep Reinforcement Learning Environments in JAX with MuJoCo MJX/Playground

Jupyter Notebook · スター 11 個
luc3d
LUC3D - Label Unification and Correspondence in 3D Annotation GUI

JavaScript · スター 4 個
lablink

Python · スター 3 個
sleap-app
Web-based labeling GUI for SLEAP animal pose estimation and tracking

TypeScript · スター 3 個
sleap-mot
Standalone multi-object tracking.

Python · スター 2 個
sleap-roots-training
Config-driven training and evaluation of SLEAP root models on the sleap-nn backend (replaces the notebook-based eberrigan/sleap-roots-tra...

Python · スター 1 個
mosquito-cfd
CFD simulations of mosquito flight aerodynamics using IAMReX

Python · スター 1 個
emdee
A fast, minimal, cross-platform markdown viewer. Opens .md files natively on macOS, Windows, and Linux.

JavaScript · スター 0 個
webRTC-connect

Python · スター 0 個
sleap-roots-analyze
Standard trait analysis for traits from sleap-roots.

Python · スター 0 個
lablink-template
Documentation for LabLink template repo.

Shell · スター 0 個
sleap-io.js

TypeScript · スター 0 個
sleap-roots-contracts
Shared result + provenance contract for the sleap-roots <-> Bloom pipeline.

Python · スター 0 個
ほか 2 件のリポジトリは GitHub で見るにあります

初心者向けすべて

オープンすべて

誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。すべて日付順に表示

Force-surrogate config-resolved R² is single-seed and strongly seed-dependent
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 38/100

talmolab/mosquito-cfd#125 · 2026年10月16日に作成
Flapping-wing V3 validation figure is stale against the coarse surrogate it reads
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 72/100

talmolab/mosquito-cfd#124 · 2026年10月16日に作成
Load Project: video-select prompt has no way out (no Cancel, no Esc) and says "SLP" for a .json
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 2/5 半日初心者へのやさしさ 62/100

talmolab/luc3d#337 · 2026年10月14日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
embedding: crop a √2-larger window before geometric aug, then center-crop (no black corners)
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

talmolab/sleap-nn#767 · 2026年10月9日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
embedding: persist the P×K sampler RNG so a resumed run doesn't replay epoch-0 batches
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap-nn#766 · 2026年10月9日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
embedding: let reduce_lr_on_plateau monitor the retrieval select_metric instead of val/loss
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap-nn#765 · 2026年10月9日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
embedding: all-gather embeddings across DDP ranks so SupCon's negative pool grows with world size
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 32/100

talmolab/sleap-nn#764 · 2026年10月9日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Inference only working when inference target is Suggestions
オープン
- 何か問題がありますか？
bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 38/100

talmolab/sleap#2883 · 2026年10月8日に作成
Pipelines raise KeyError 'plant_name' on a scan with zero labeled frames (sleap-nn predict output for an empty tube)
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 68/100

talmolab/sleap-roots#280 · 2026年10月5日に作成
Failed Bloom runs lose their Workflow and pod logs ~1 h after finishing (ttlStrategy), with no alert
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#137 · 2026年10月4日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
docs: guides/index.md Quick Reference monocot rows contradict production pipeline selection (wheat, rice age split)
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 68/100

talmolab/sleap-roots#279 · 2026年10月4日に作成
Write a production runbook (docs/bloom-integration/operations.md)
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 66/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#132 · 2026年10月4日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
registry: close seed-registry robustness gaps and clean up model-registry spec text (follow-up to #73/#75)
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap-roots-training#76 · 2026年10月4日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
check_manifests.py gate assertions fail spuriously under PowerShell (picks WSL's bash.exe)
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 80/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#128 · 2026年10月4日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Re-verify the predictor's podSpecPatch GPU reorder after any Argo or Run:ai upgrade
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#127 · 2026年10月4日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Warn (or fail) when device="auto" resolves to CPU even though a GPU was assigned
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 66/100

talmolab/sleap-roots-predict#52 · 2026年10月4日に作成
Check past-window parity: pipeline_selection.yaml windows vs live model-registry windows
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

talmolab/sleap-roots#274 · コメント 1 件 · 2026年10月2日に作成
convhull/points: module-level logging calls implicitly run logging.basicConfig()
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 88/100

talmolab/sleap-roots#273 · 2026年10月2日に作成
check_cluster_drift.sh: a failed per-template kubectl get is reported as NOT REGISTERED (drift), not CHECK FAILED
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 88/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#109 · 2026年10月2日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
A pod that never schedules holds its semaphore slot forever: add a pending-pod timeout to the gated templates
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#106 · 2026年10月1日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Should contracts provide a shared compute_recipe_key() next to compute_idempotency_key?
オープン
- 何か問題がありますか？
question

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap-roots-contracts#47 · 2026年9月29日に作成
Provenance: record the model-card alias predict chose models from (predict_model_alias)
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap-roots-contracts#46 · 2026年9月29日に作成
Provenance: record the traits Pipeline class (traits_pipeline_class)
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

talmolab/sleap-roots-contracts#45 · 2026年9月29日に作成
traits: a failed run-manifest forward should fail the batch, not just log a warning
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 55/100

talmolab/sleap-roots#271 · 2026年9月29日に作成
field_surrogate: reject inverted lo > hi region requests
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 75/100

talmolab/mosquito-cfd#122 · 2026年9月28日に作成
field_surrogate: FieldCorpus plotfile() fast path, step validation, duplicate steps
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 67/100

talmolab/mosquito-cfd#121 · コメント 1 件 · 2026年9月28日に作成
field_surrogate: read_field_snapshot peak memory and yt objects retained until GC
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

talmolab/mosquito-cfd#120 · コメント 2 件 · 2026年9月28日に作成
Acceptance gate stops at the first ConfigExtractionError instead of enumerating every config
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

talmolab/mosquito-cfd#119 · コメント 2 件 · 2026年9月28日に作成
Inventory mode derivation: no multiplant token, and conflicting mode tokens resolve silently
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 52/100

talmolab/sleap-roots-training#65 · コメント 1 件 · 2026年9月24日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Published-collections skeleton check cannot resolve any collection: every skeleton is named Skeleton-N
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap-roots-training#64 · コメント 1 件 · 2026年9月24日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
skeletons.yaml has no multiplant cylinder rows; multiplant labels are unidentified
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

talmolab/sleap-roots-training#62 · コメント 1 件 · 2026年9月24日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
No inference predictions from multi_class_bottomup for side cameras outside cylinder
オープン
- 何か問題がありますか？
bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap#2873 · コメント 2 件 · 2026年9月24日に作成
package_metadata.yaml omits the age window its spec requires
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 75/100

talmolab/sleap-roots-training#60 · 2026年9月23日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Labelled files on the share mix species; the single-species rule is unverified
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

talmolab/sleap-roots-training#59 · コメント 2 件 · 2026年9月23日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Fail-loud trait-extractor exit 1 is retried twice, then write-back still runs over a stale manifest
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#86 · 2026年9月23日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Decide a GC policy for accumulated per-run manifests in the shared output trees
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#83 · 2026年9月23日に作成

メンテナーはふだん 1 日以内に返信
Add a run-manifest name recogniser (is_run_manifest_name / run_manifest_run_id) when the first cleanup caller exists
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 75/100

talmolab/sleap-roots-contracts#43 · 2026年9月23日に作成
read_run_manifest: resolve candidates under a single dir_fd instead of a post-hoc is_dir() check
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 60/100

talmolab/sleap-roots-contracts#42 · 2026年9月23日に作成
Evidence figure prints off-panel CF_mx/CF_mz R2 onto the PNG but the sidecar does not record them
オープン
- 何か問題がありますか？
bug

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 85/100

talmolab/mosquito-cfd#116 · 2026年9月22日に作成
Live force-surrogate spec restates result numbers that no longer match the committed artifacts
オープン
- 何か問題がありますか？
bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 72/100

talmolab/mosquito-cfd#115 · 2026年9月22日に作成
Build the first real coarse-vs-fine comparison figures once the fine surrogate exists
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

talmolab/mosquito-cfd#114 · 2026年9月22日に作成
Provenance records no identity for the ingesting agent, and write-back cannot self-stamp without breaking verbatim passthrough
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

talmolab/sleap-roots-contracts#40 · 2026年9月22日に作成
field-surrogate reader: robustness and provenance follow-ups from the #105/#106 review
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/mosquito-cfd#113 · 2026年9月22日に作成
field-surrogate reader: measured performance work before F3's training loop (NFS stat storm, duplicated grid, covering-grid retention)
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 38/100

talmolab/mosquito-cfd#112 · コメント 1 件 · 2026年9月22日に作成
Extend the van Veen quasi-steady model to moments: spanwise bending is derivable from the published coefficients
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 52/100

talmolab/mosquito-cfd#111 · 2026年9月22日に作成
Train the force surrogate on the corrected fine corpus and build its evidence figure
オープン
- 何か問題がありますか？
enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

talmolab/mosquito-cfd#110 · 2026年9月22日に作成
Force/moment sign convention is unverified on the wing path: ib_force is the force on the fluid, and nothing negates it
オープン
- 何か問題がありますか？
bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

talmolab/mosquito-cfd#109 · 2026年9月22日に作成
Committed plotfile fixture is degenerate: add one with a non-zero origin, anisotropic dx, and >1 FAB
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 68/100

talmolab/mosquito-cfd#107 · コメント 1 件 · 2026年9月22日に作成
sweep_provenance.json's supersession_history has no writer -- manual restoration required on every corpus regeneration
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 68/100

talmolab/mosquito-cfd#103 · 2026年9月21日に作成
No Git LFS for committed corpus parquet binaries (growing packfile)
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

talmolab/mosquito-cfd#102 · コメント 2 件 · 2026年9月21日に作成

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