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A deep learning framework for multi-animal pose tracking.

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Implementation of STAC using MJX for GPU acceleration. Part of VNL project.

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Standalone utilities for SLEAP pose tracking data.

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Neural network backend for training and inference for animal pose estimation.

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Force-surrogate config-resolved R² is single-seed and strongly seed-dependent
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100

talmolab/mosquito-cfd#125 · Aperta il 16/10/2026
Flapping-wing V3 validation figure is stale against the coarse surrogate it reads
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100

talmolab/mosquito-cfd#124 · Aperta il 16/10/2026
Load Project: video-select prompt has no way out (no Cancel, no Esc) and says "SLP" for a .json
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 Mezza giornata Idoneità per principianti 62/100

talmolab/luc3d#337 · Aperta il 14/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
embedding: crop a √2-larger window before geometric aug, then center-crop (no black corners)
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

talmolab/sleap-nn#767 · Aperta il 9/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
embedding: persist the P×K sampler RNG so a resumed run doesn't replay epoch-0 batches
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap-nn#766 · Aperta il 9/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
embedding: let reduce_lr_on_plateau monitor the retrieval select_metric instead of val/loss
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap-nn#765 · Aperta il 9/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
embedding: all-gather embeddings across DDP ranks so SupCon's negative pool grows with world size
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 32/100

talmolab/sleap-nn#764 · Aperta il 9/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Inference only working when inference target is Suggestions
Aperta
- Qualcosa non va?
bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100

talmolab/sleap#2883 · Aperta il 8/10/2026
Pipelines raise KeyError 'plant_name' on a scan with zero labeled frames (sleap-nn predict output for an empty tube)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 68/100

talmolab/sleap-roots#280 · Aperta il 5/10/2026
Failed Bloom runs lose their Workflow and pod logs ~1 h after finishing (ttlStrategy), with no alert
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#137 · Aperta il 4/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
docs: guides/index.md Quick Reference monocot rows contradict production pipeline selection (wheat, rice age split)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 68/100

talmolab/sleap-roots#279 · Aperta il 4/10/2026
Write a production runbook (docs/bloom-integration/operations.md)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 66/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#132 · Aperta il 4/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
registry: close seed-registry robustness gaps and clean up model-registry spec text (follow-up to #73/#75)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap-roots-training#76 · Aperta il 4/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
check_manifests.py gate assertions fail spuriously under PowerShell (picks WSL's bash.exe)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 80/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#128 · Aperta il 4/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Re-verify the predictor's podSpecPatch GPU reorder after any Argo or Run:ai upgrade
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#127 · Aperta il 4/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Warn (or fail) when device="auto" resolves to CPU even though a GPU was assigned
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 66/100

talmolab/sleap-roots-predict#52 · Aperta il 4/10/2026
Check past-window parity: pipeline_selection.yaml windows vs live model-registry windows
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

talmolab/sleap-roots#274 · 1 commento · Aperta il 2/10/2026
convhull/points: module-level logging calls implicitly run logging.basicConfig()
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 88/100

talmolab/sleap-roots#273 · Aperta il 2/10/2026
check_cluster_drift.sh: a failed per-template kubectl get is reported as NOT REGISTERED (drift), not CHECK FAILED
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 88/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#109 · Aperta il 2/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
A pod that never schedules holds its semaphore slot forever: add a pending-pod timeout to the gated templates
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#106 · Aperta il 1/10/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Should contracts provide a shared compute_recipe_key() next to compute_idempotency_key?
Aperta
- Qualcosa non va?
question

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap-roots-contracts#47 · Aperta il 29/9/2026
Provenance: record the model-card alias predict chose models from (predict_model_alias)
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap-roots-contracts#46 · Aperta il 29/9/2026
Provenance: record the traits Pipeline class (traits_pipeline_class)
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

talmolab/sleap-roots-contracts#45 · Aperta il 29/9/2026
traits: a failed run-manifest forward should fail the batch, not just log a warning
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100

talmolab/sleap-roots#271 · Aperta il 29/9/2026
field_surrogate: reject inverted lo > hi region requests
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 75/100

talmolab/mosquito-cfd#122 · Aperta il 28/9/2026
field_surrogate: FieldCorpus plotfile() fast path, step validation, duplicate steps
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 67/100

talmolab/mosquito-cfd#121 · 1 commento · Aperta il 28/9/2026
field_surrogate: read_field_snapshot peak memory and yt objects retained until GC
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

talmolab/mosquito-cfd#120 · 2 commenti · Aperta il 28/9/2026
Acceptance gate stops at the first ConfigExtractionError instead of enumerating every config
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

talmolab/mosquito-cfd#119 · 2 commenti · Aperta il 28/9/2026
Inventory mode derivation: no multiplant token, and conflicting mode tokens resolve silently
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 52/100

talmolab/sleap-roots-training#65 · 1 commento · Aperta il 24/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Published-collections skeleton check cannot resolve any collection: every skeleton is named Skeleton-N
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap-roots-training#64 · 1 commento · Aperta il 24/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
skeletons.yaml has no multiplant cylinder rows; multiplant labels are unidentified
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

talmolab/sleap-roots-training#62 · 1 commento · Aperta il 24/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
No inference predictions from multi_class_bottomup for side cameras outside cylinder
Aperta
- Qualcosa non va?
bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap#2873 · 2 commenti · Aperta il 24/9/2026
package_metadata.yaml omits the age window its spec requires
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 75/100

talmolab/sleap-roots-training#60 · Aperta il 23/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Labelled files on the share mix species; the single-species rule is unverified
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

talmolab/sleap-roots-training#59 · 2 commenti · Aperta il 23/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Fail-loud trait-extractor exit 1 is retried twice, then write-back still runs over a stale manifest
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#86 · Aperta il 23/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Decide a GC policy for accumulated per-run manifests in the shared output trees
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

talmolab/sleap-roots-pipeline#83 · Aperta il 23/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Add a run-manifest name recogniser (is_run_manifest_name / run_manifest_run_id) when the first cleanup caller exists
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 75/100

talmolab/sleap-roots-contracts#43 · Aperta il 23/9/2026
read_run_manifest: resolve candidates under a single dir_fd instead of a post-hoc is_dir() check
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 60/100

talmolab/sleap-roots-contracts#42 · Aperta il 23/9/2026
Evidence figure prints off-panel CF_mx/CF_mz R2 onto the PNG but the sidecar does not record them
Aperta
- Qualcosa non va?
bug

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 85/100

talmolab/mosquito-cfd#116 · Aperta il 22/9/2026
Live force-surrogate spec restates result numbers that no longer match the committed artifacts
Aperta
- Qualcosa non va?
bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 72/100

talmolab/mosquito-cfd#115 · Aperta il 22/9/2026
Build the first real coarse-vs-fine comparison figures once the fine surrogate exists
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

talmolab/mosquito-cfd#114 · Aperta il 22/9/2026
Provenance records no identity for the ingesting agent, and write-back cannot self-stamp without breaking verbatim passthrough
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

talmolab/sleap-roots-contracts#40 · Aperta il 22/9/2026
field-surrogate reader: robustness and provenance follow-ups from the #105/#106 review
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

talmolab/mosquito-cfd#113 · Aperta il 22/9/2026
field-surrogate reader: measured performance work before F3's training loop (NFS stat storm, duplicated grid, covering-grid retention)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 38/100

talmolab/mosquito-cfd#112 · 1 commento · Aperta il 22/9/2026
Extend the van Veen quasi-steady model to moments: spanwise bending is derivable from the published coefficients
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100

talmolab/mosquito-cfd#111 · Aperta il 22/9/2026
Train the force surrogate on the corrected fine corpus and build its evidence figure
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

talmolab/mosquito-cfd#110 · Aperta il 22/9/2026
Force/moment sign convention is unverified on the wing path: ib_force is the force on the fluid, and nothing negates it
Aperta
- Qualcosa non va?
bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

talmolab/mosquito-cfd#109 · Aperta il 22/9/2026
Committed plotfile fixture is degenerate: add one with a non-zero origin, anisotropic dx, and >1 FAB
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 68/100

talmolab/mosquito-cfd#107 · 1 commento · Aperta il 22/9/2026
sweep_provenance.json's supersession_history has no writer -- manual restoration required on every corpus regeneration
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 68/100

talmolab/mosquito-cfd#103 · Aperta il 21/9/2026
No Git LFS for committed corpus parquet binaries (growing packfile)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

talmolab/mosquito-cfd#102 · 2 commenti · Aperta il 21/9/2026

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