obophenotype/uberon

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• #gogoeditdiff classification diff fails: HRA component overrides need COMP=true

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

  obophenotype/uberon#3809 · 2026年10月28日 に作成

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• "antenna" should be part of "sensory system" (at least with GCI)

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  uberon-classhierarchy

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 62/100

  obophenotype/uberon#3808 · コメント 4 件 · 2026年10月28日 に作成

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• Knee joint: add part_of for patella and the articulating ends of femur and tibia

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  uberon-classhierarchy

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  obophenotype/uberon#3801 · 2026年10月23日 に作成

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• Add part_of knee joint to infrapatellar fat pad (UBERON:0016400)

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  uberon-classhierarchy

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 62/100

  obophenotype/uberon#3800 · 2026年10月23日 に作成

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• Replace SNOMED CT structure (S node) xrefs with entire (E node) xrefs

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  obophenotype/uberon#3786 · 2026年10月9日 に作成

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• UBERON:0000125 “neural nucleus” xref NCIT:C13197 points to cell nucleus

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 65/100

  obophenotype/uberon#3785 · 2026年10月8日 に作成

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• Taxon-specific ontology generation using composite-metazoan

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 22/100

  obophenotype/uberon#3784 · 2026年10月8日 に作成

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• NTR: extended amygdala (DHBA:10383)

  オープン

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  new term request

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 68/100

  obophenotype/uberon#3783 · 2026年10月6日 に作成

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• make with COMP=false fails: HRA component overrides in uberon.Makefile depend on undefined stamp rule (breaks #gogoeditdiff)

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 84/100

  obophenotype/uberon#3780 · 2026年9月28日 に作成

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• Implement CLARA on Uberon GA

  再び着手できるかも @ubyndr が 38 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  obophenotype/uberon#3778 · 担当者 1 名 · 2026年9月21日 に作成

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• [Fix] UBERON:0003351 'pharyngeal epithelium' is chordate-restricted but generically labelled

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  obophenotype/uberon#3776 · コメント 2 件 · 2026年9月18日 に作成

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• 11 definitions in the 2026-06-19 release promise a `part_of` the axioms do not state, and 21 HPO phenotype definitions rest on those terms, and 20 automatic definitions place a metapodial element inside a digit the axioms declare disjoint from it

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  obophenotype/uberon#3773 · 2026年9月18日 に作成

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• Missing has_part relations to CL: systematic scan of term definitions (33 evidence-backed candidates)

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  obophenotype/uberon#3769 · 2026年9月14日 に作成

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• "thigh" may not be an appropriate exact synonym of `hindlimb stylopod`

  オープン

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  obophenotype/uberon#3768 · コメント 5 件 · 2026年9月11日 に作成

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• Definitions vs axioms in the 2026-06-19 release: a tooth both inside the head and disjoint from it, three terms whose definition and axiom disagree, and 12 candidate `part_of` axioms

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  obophenotype/uberon#3767 · コメント 1 件 · 2026年9月11日 に作成

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• State publicly where specimen / sample-type terms belong (organoid, cell culture, PBMC, biopsy)

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100

  obophenotype/uberon#3766 · 2026年9月7日 に作成

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• Track Uberon/CL single-cell coverage as a recurring report

  オープン

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 72/100

  obophenotype/uberon#3765 · 2026年9月7日 に作成

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• Create a single-cell sampling-site subset from observed usage

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 52/100

  obophenotype/uberon#3764 · 2026年9月7日 に作成

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• Update the code that refreshes the PORO ontology

  再び着手できるかも @gouttegd が 59 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  composite

  obophenotype/uberon#3763 · 担当者 1 名 · 2026年8月31日 に作成

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• Versioning mismatch

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100

  obophenotype/uberon#3756 · 2026年8月21日 に作成

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• mandibular organ

  オープン

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  new term request

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 68/100

  obophenotype/uberon#3755 · 2026年8月18日 に作成

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• NTR: arthropod spinneret

  オープン

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 64/100

  obophenotype/uberon#3753 · 2026年8月17日 に作成

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• crustacean eyestalk

  オープン

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  難易度 3/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 55/100

  obophenotype/uberon#3750 · 2026年8月6日 に作成

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• Question about an Arthropod Anatomy Ontology and NTR: Haller's organ

  オープン

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  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  obophenotype/uberon#3749 · コメント 1 件 · 2026年8月4日 に作成

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• UBERON:0023867 islands of Calleja of olfactory tubercle, relationship and taxon constraint

  オープン

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  textual definition

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 50/100

  obophenotype/uberon#3747 · 2026年8月3日 に作成

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• Please revisit issue #2688

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

  obophenotype/uberon#3746 · 2026年7月28日 に作成

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• test2

  再び着手できるかも このイシューのプルリクエストはマージされずにクローズされました。 オープン

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  難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 72/100

  obophenotype/uberon#3743 · コメント 2 件 · リアクション 1 件 · 2026年7月28日 に作成

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• hemichordata hepatic region

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 65/100

  obophenotype/uberon#3740 · 2026年7月27日 に作成

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• NTR: pancreas of Aselli

  オープン

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  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100

  obophenotype/uberon#3736 · 2026年7月13日 に作成

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• Completing HRA branches

  オープン

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  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 28/100

  obophenotype/uberon#3735 · 2026年7月6日 に作成

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• Update periodontium

  オープン

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  obophenotype/uberon#3734 · 2026年6月23日 に作成

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• Refinements to bulk workflow and reporting

  オープン

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  obophenotype/uberon#3726 · 2026年6月1日 に作成

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• review taxonomic distribution: syrinx

  オープン

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  obophenotype/uberon#3725 · コメント 2 件 · リアクション 1 件 · 2026年6月1日 に作成

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• Assert that mouth is part of the upper respiratory tract

  オープン

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  logical definition

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  obophenotype/uberon#3724 · 2026年5月26日 に作成

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• Feature request: Template-aware definitive ID allocation

  再び着手できるかも @dosumis が 164 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

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  obophenotype/uberon#3708 · 担当者 1 名 · 2026年5月18日 に作成

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• NTR: cnidarian polyp stage

  オープン

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  new term request

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  obophenotype/uberon#3706 · 2026年5月11日 に作成

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• Epic: next-wave AI workflow, governance, and contributor-control improvements

  オープン

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  tech

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

  obophenotype/uberon#3691 · 2026年4月23日 に作成

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• Add 'added_by_HRA' subset to approrpriate Uberon terms

  オープン

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  obophenotype/uberon#3680 · コメント 2 件 · 2026年3月22日 に作成

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• New term request: abdominal tergum

  オープン

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  obophenotype/uberon#3677 · コメント 2 件 · 2026年3月17日 に作成

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• New term requests for hemimetabolous insect structures: wing pad, forewing pad (W2), hind wing pad (W3)

  オープン

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  obophenotype/uberon#3674 · コメント 1 件 · 2026年3月17日 に作成

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• New term request for epiploic adipose tissue

  オープン

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  obophenotype/uberon#3670 · コメント 1 件 · 2026年3月5日 に作成

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• New term request for inferior left pulmonary vein

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  obophenotype/uberon#3669 · コメント 1 件 · 2026年3月5日 に作成

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• New term request for superior left pulmonary vein

  オープン

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  obophenotype/uberon#3668 · コメント 1 件 · 2026年3月5日 に作成

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• New term request for inferior descending thoracic aorta

  オープン

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  obophenotype/uberon#3667 · コメント 1 件 · 2026年3月5日 に作成

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• New term request for superior descending thoracic aorta

  オープン

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  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 58/100

  obophenotype/uberon#3666 · コメント 1 件 · 2026年3月5日 に作成

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• New term request for posterior left cardiac atrium

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  obophenotype/uberon#3665 · コメント 1 件 · 2026年3月2日 に作成

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• New term request for anterior left cardiac atrium

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  obophenotype/uberon#3664 · コメント 1 件 · 2026年3月2日 に作成

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• New term request for Left hippocampus formation

  オープン

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  obophenotype/uberon#3663 · コメント 1 件 · 2026年2月26日 に作成

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• New term request for Right hippocampus formation

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  obophenotype/uberon#3662 · コメント 1 件 · 2026年2月26日 に作成

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• Correct "collecting duct of renal tubule" mapping to SNOMED

  オープン

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  obophenotype/uberon#3661 · コメント 1 件 · 2026年2月18日 に作成

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