Hacktoberfest 2026：メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

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milaboratory

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誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

  • `assembleContigs` killed by OOM with 512 GB RAM allocated — very large `parsebio-sc-bcr-evercode` dataset (~606M alignments)
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    milaboratory/mixcr#2158 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Error in lane-split samples analysis
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    milaboratory/mixcr#2144 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Appropriate preset for single-cell BCR data from SMART-Seq v4 kit (well-sorted, no UMI)?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

    milaboratory/mixcr#2130 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Creating a custom OGRDB+IMGT library, repseqio 1.7 mixcr 4.7 errors
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/mixcr#2127 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • why no new releases after 4.7.0 after Aug 7, 2024 ?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 28/100

    milaboratory/mixcr#2126 · コメント 6 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Running MiXCR on BAM files - GRCh37 vs GRCh38 input
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#2125 · コメント 3 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Title: License error: ConnectionError persists even after updating to latest version and re-applying Academic license
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/mixcr#2095 · コメント 3 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Error with assembleCells preventing the 10x-sc-xcr-vdj pipeline from compeleting
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

    milaboratory/mixcr#2083 · コメント 3 件 · リアクション 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Low cell count
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/mixcr#2082 · コメント 3 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Question about long read paramter
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#2078 · コメント 4 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Inconsistent FinalClonotypes between two sequencing platforms on the same sample
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#2076 · コメント 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • repseqio updates?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#2075 · コメント 3 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Why would special letters happen in the results?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#2062 · コメント 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Error running MiXCR on ONT long read data
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 32/100

    milaboratory/mixcr#2052 · コメント 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Request for Assistance with 10x 5' V3 VDJ Data Processing in mixcr v4.7.0
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#2050 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Configuring MiXCR for custom Bulk BCR/TCR-seq with structured UMI for full-length VDJ assembly
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#2047 · コメント 3 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Error parsing read "Cannot read field "regions" because "<local6>" is null'" when aligning concatenated single-end amplicon sequences with virtual paired-end input
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/mixcr#2046 · コメント 5 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • exportAlignments -readIds parameter exports numeric index ‘0‘ instead of actual FASTQ read identifiers
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/mixcr#2045 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • How to associate MiXCR clone results with Cx/Cy coordinates (from BAM tags)?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/mixcr#2041 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • single-cell data analysis - exportAirr
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    milaboratory/mixcr#2027 · コメント 10 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • error when using extend with clna file
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

    milaboratory/mixcr#2003 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • problem with a specific BCR clone in running preset 10x for single cell
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#1977 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Question about findShmTrees
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#1971 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Problem with Custom Library Build java.net.URISyntaxException
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/mixcr#1948 · コメント 4 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • java problem with mixcr
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 20/100

    milaboratory/mixcr#1944 · コメント 8 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Mixcr assemble clonotypes
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 20/100

    milaboratory/mixcr#1940 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Building a yaml. preset for my custom library
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#1939 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Help needed to modify MIXCR preset for full sequence alignment using cDNA
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

    milaboratory/mixcr#1936 · コメント 3 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Species list
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/docs#66 · コメント 1 件 ·

  • Low clonotype group sizes and interpretation help - 10x VDJ
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/mixcr#1916 · コメント 5 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Normalization among samples from different sequencing runs
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    milaboratory/docs#65 ·

  • Difference between assembledCells.clns vs contigs.clns?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/docs#64 · コメント 1 件 ·

  • Postanalysis summary statistics not fully reproducible manually
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 42/100

    milaboratory/mixcr#1850 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Create a shareable eslint config as an npm package (with prettier integrated)
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    milaboratory/platforma#199 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Add single-point error handler in ML
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#176 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [sdk/ui-vue] Ag-grid: re-export components & move styles to assets (with review & clean up)
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#172 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Fix LsDriver.getLocalFileHandle behaviour in local mode
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#165 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Implement more secure file access with security scoped bookmarks
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/platforma#164 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Review drivers computable state reporting logic
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#161 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [sdk/workflow-tengo] exec: support `addFiles(ref)`
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    milaboratory/platforma#143 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Batch tree sync requests
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

    milaboratory/platforma#142 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Better type names
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/platforma#126 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Fix tengo-wf aggregation with partitionLength = 0
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#125 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Minor issue with file dialog with small screen
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#123 · 担当者 2 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Hide files not matching filtering extensions PlFileInput
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#120 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Check that we add mtime to BlobUpload when create one
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#86 · 担当者 2 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Make sure license is passed as secret in docker pl-bootstrap deployment
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#79 · 担当者 2 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Prevent malformed PColumns to poison context
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#78 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [sdk/model] Rename `Ref` to `ResultRef`
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    milaboratory/platforma#70 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • [sdk/ui-vue] `PlFileInput` component: open folder with selected file by default
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    milaboratory/platforma#67 · 担当者 1 名 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

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