Weekly notebook sweep — failures (2026-05-18)
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 35/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 活発
- 技術スタック
- jupyter-notebook
- 領域
- testing
調査の方向性
まず、Issue に記載されている失敗した6つの notebook を再実行し、報告された execute ステージのエラーを調査します。NWB ファイルの欠落に関する失敗と、h5py の ROS3 サポートに関する失敗を比較します。週次スイープですべての6つの notebook が正常に実行されれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Weekly notebook sweep — run 26019683242
Total: 34 · Passed: 28 · Failed: 6
Other failures
001038/DombeckLab/001038_demo.ipynb(stage:execute, 26.2s) —{'attributes': {'description': 'Link to the optical fiber device.', 'namespace': 'hdmf-experimental', 'neurodata_type': 'VectorData', 'object_id': 'f7f800f5-81d0-4223-a0fe-3cafcbe49611'}, 'data': <hdm001084/HoweLab/001084_demo.ipynb(stage:execute, 23.7s) —'An optical channel of the microscope.'}, 'emission_lambda': root/general/optophysiology/ImagingPlaneGreen/Green/emission_lambda DatasetBuilder {'attributes': {}, 'data': np.float64(511.0)}}, 'links':001712/IBL-Widefield/public_demo/anatomical_localization_widefield.ipynb(stage:execute, 19.6s) —ValueError: Expected 1 file, found 0 for pattern sub-FD-28/sub-FD-28_ses-81f90b18-e61c-4d32-bbce-3e0c5f33f06c_desc-raw*.nwb001712/IBL-Widefield/public_demo/processed_widefield.ipynb(stage:execute, 24.9s) —ValueError: Expected 1 file, found 0 for pattern sub-CSK-im-011/sub-CSK-im-011_ses-d34a502f-bd06-471f-8334-df41f785e1d9_desc-processed*.nwbdandi/DANDI User Guide, Part I.ipynb(stage:execute, 28.7s) —ValueError: h5py was built without ROS3 support, can't use ros3 driverdemos/NWBWidget-demo.ipynb(stage:execute, 21.3s) —ValueError: h5py was built without ROS3 support, can't use ros3 driver
Passed
000971/lernerlab/seiler_2024/optogenetics_example_notebook.ipynb(19.6s)001712/IBL-Widefield/public_demo/raw_widefield.ipynb(27.7s)001636/TurnerLab/motor_cortex/turner_m1_usage.ipynb(28.9s)000971/lernerlab/seiler_2024/fiber_photometry_example_notebook.ipynb(29.8s)tutorials/bcm_2024/analysis-demo.ipynb(31.3s)000947/TurnerLab/public_demo/000947_demo.ipynb(32.7s)001754/CatalystNeuro/001754_demo.ipynb(33.2s)001636/TurnerLab/motor_cortex/antidromic_detection_tutorial.ipynb(33.4s)000559/dattalab/markowitz_gillis_nature_2023/reproduce_figure1d.ipynb(34.2s)001636/TurnerLab/motor_cortex/turner_m1_peth.ipynb(36.9s)000458/FlatironInstitute/000_lindi_vs_fsspec_streaming.ipynb(37.1s)dandi/DANDI User Guide, Part II.ipynb(39.1s)000458/AllenInstitute/reanalysis.ipynb(42.4s)000727/clandinin/simple_data_access/reading_data.ipynb(46.7s)001636/TurnerLab/motor_cortex/turner_m1_glm.ipynb(50.2s)tutorials/open_data_quick_start_2026/Get-to-know-a-Dandiset.ipynb(59.1s)000718/CaiLab/zaki_2024/000718_demo.ipynb(71.8s)000728/AllenInstitute/visual_coding_ophys_tutorial.ipynb(72.3s)tutorials/cosyne_2023/simple_dandiset_search.ipynb(75.1s)000409/IBL/bwm_usage_notebook.ipynb(102.6s)000582/Sargolini2006/000582_Sargolini2006_demo.ipynb(129.8s)tutorials/neurodatarehack_2024/simple_dandiset_search.ipynb(142.7s)001075/001075_paper_figure_1d.ipynb(149.2s)000458/FlatironInstitute/001_summarize_contents.ipynb(154.2s)tutorials/neurodatarehack_2024/advanced_asset_search.ipynb(171.2s)000559/dattalab/markowitz_gillis_nature_2023/reproduce_figure_S1.ipynb(297.5s)000108/chunglab/demo/dashboard.ipynb(406.4s)000402/MICrONS/demo/000402_microns_demo.ipynb(1264.2s)
- 主要言語
- Jupyter Notebook
- スター
- 9
- フォーク
- 20
- 平均マージ
- 1時間 56分
- マージ済み PR（30日）
- 2
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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