bioconda

誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

• homer 5.1: compiled tools carry an RPATH into the build env, so they fail to load libstdc++ (and HOMER exits 0 with empty results)

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

  bioconda/bioconda-recipes#70249 · 2026年10月13日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• macs2 2.2.9.1 linux-64 builds _2 through _5 reference __log_finite/__exp_finite and fail to import on glibc >= 2.31 (incl. the biocontainers image)

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  bioconda/bioconda-recipes#70217 · 2026年10月13日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• humann 3.9 (noarch) ships its own x86-64 diamond 2.0.15 and bowtie2 2.2.3 in bin/, overwriting its declared run deps

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 72/100

  bioconda/bioconda-recipes#70213 · 2026年10月13日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [update] ensembl-vep 116.2 -> 116.3

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 69/100

  bioconda/bioconda-recipes#70187 · 2026年10月12日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [update] mrbayes 3.2.8 -> 3.2.9

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 67/100

  bioconda/bioconda-recipes#70186 · 2026年10月12日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [update] bioconductor-methylkit 1.36.0 -> 1.38.0

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100

  bioconda/bioconda-recipes#70185 · 2026年10月12日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [update] bioconductor-geneselectmmd 2.54.0 -> 2.56.0

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 67/100

  bioconda/bioconda-recipes#70184 · 2026年10月12日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [update] gatk4 4.6.2.0 -> 4.7.0.0

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 57/100

  bioconda/bioconda-recipes#70183 · コメント 1 件 · 2026年10月12日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [update] bioconductor-biovizbase 1.58.0 -> 1.60.0

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 62/100

  bioconda/bioconda-recipes#70182 · 2026年10月12日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• ucsc-blat 482 (osx-arm64): blat has an invalid code signature and is killed at launch (exit 137)

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 78/100

  bioconda/bioconda-recipes#70167 · 2026年10月11日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• r-saige 1.3.1: SAIGE.so needs the removed tbb::task API, so library(SAIGE) fails on linux-64 and linux-aarch64

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

  bioconda/bioconda-recipes#70035 · 2026年10月8日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Six packages ship x86-64 binaries under linux-aarch64 or noarch; nothing lints ELF arch against subdir

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

  bioconda/bioconda-recipes#69811 · コメント 3 件 · 2026年10月2日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [broken package] Seqfu has non working versions

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 52/100

  bioconda/bioconda-recipes#69758 · 2026年9月30日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• package bioconductor-depmap cannot be installed in prefix with spaces

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 62/100

  bioconda/bioconda-recipes#69522 · 2026年9月22日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Generating PDF report with MAGeCK does not work anymore

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 42/100

  bioconda/bioconda-recipes#69499 · 2026年9月22日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• repaq xz dependency

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

  bioconda/bioconda-recipes#69342 · 2026年9月17日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• gnuplot-py 1.8 py3 build ships partially converted code (2to3 aborts silently)

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

  bioconda/bioconda-recipes#68921 · 2026年9月8日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• pycoqc: h5py=2.9.0 pin is the only thing blocking linux-aarch64

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 72/100

  bioconda/bioconda-recipes#68793 · コメント 2 件 · 2026年9月3日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• gtdbtk and comebin pin pplacer =1.1.alpha19, the one version without linux-aarch64

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 52/100

  bioconda/bioconda-recipes#68792 · コメント 1 件 · 2026年9月3日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• gatk4: multi-output split dropped noarch, so gatk4-main/gatk4-spark have no arm64 build

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 72/100

  bioconda/bioconda-recipes#68791 · 2026年9月3日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• metamdbg: additional-platforms block removed in 1.3, dropping linux-aarch64 and osx-arm64

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 88/100

  bioconda/bioconda-recipes#68790 · 2026年9月3日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Recipe updates that change source URL to a fork

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル
  question

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 22/100

  bioconda/bioconda-recipes#68715 · 2026年9月2日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Conda-forge migration or dual-channel guidance for dotmatch

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 22/100

  bioconda/bioconda-recipes#68387 · コメント 3 件 · 2026年8月22日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Bulk update Bioconductor recipes to Bioconductor 3.23 / R 4.6

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 18/100

  bioconda/bioconda-recipes#68225 · コメント 2 件 · リアクション 1 件 · 2026年8月17日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [broken package] All native osx-arm64 megahit=1.2.9 builds are broken (AttributeError & Exit -11)

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 48/100

  bioconda/bioconda-recipes#68074 · 2026年8月11日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• [broken package] Multiple osx-64 megahit=1.2.9 builds fail test suite (Exit -6, Exit -11, AttributeError)

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

  bioconda/bioconda-recipes#68073 · コメント 1 件 · 2026年8月11日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Suspicious number of downloads for Harpy

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 22/100

  bioconda/bioconda-recipes#68071 · 2026年8月11日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Bioconda: hmftools wrappers force an unavailable locale

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 68/100

  bioconda/bioconda-recipes#67947 · 2026年8月7日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Pause auto merging of autobumps with proposed changes

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

  bioconda/bioconda-recipes#67365 · コメント 1 件 · リアクション 2 件 · 2026年7月21日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• gatk4 openjdk>=17.0 dependency

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 55/100

  bioconda/bioconda-recipes#66708 · コメント 3 件 · 2026年6月26日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• pygenomeviz 0.4.4 fails to install.

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  bioconda/bioconda-recipes#65137 · コメント 2 件 · 2026年5月6日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• ont-modkit 0.6.2 package contains 0.6.1 binary

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 54/100

  bioconda/bioconda-recipes#65105 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 · 2026年5月5日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• sra-human-scrubber includes x86 binary, and isn't really no-arch

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

  bioconda/bioconda-recipes#65077 · コメント 1 件 · 2026年5月4日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Add Ne2-1L binary on PATH of r-rldne package

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 48/100

  bioconda/bioconda-recipes#65040 · 2026年5月2日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• admixture website has moved, including download link in build script

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 50/100

  bioconda/bioconda-recipes#64982 · 2026年4月30日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• install new Rust stable and nightly

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

  bioconda/bioconda-recipes#63328 · コメント 1 件 · 2026年3月7日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Prevent accidentally pushing tags

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 18/100

  bioconda/bioconda-utils#1078 · 2026年2月11日 に作成

• Request to mark versions 1.2, 1.5, 1.7 of VITAP as broken

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

  bioconda/bioconda-recipes#62412 · 2026年2月5日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Flagging duplicate pull requests for the same recipe

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

  bioconda/bioconda-recipes#61357 · リアクション 1 件 · 2025年12月15日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• `ensembl-vep` segmentation fault with macOS arm64

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 42/100

  bioconda/bioconda-recipes#61335 · コメント 3 件 · リアクション 1 件 · 2025年12月13日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• gatk4 has a pin on python 3.10 that doesn't exist in meta.yml

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 35/100

  bioconda/bioconda-recipes#61213 · コメント 2 件 · 2025年12月9日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• centos-7 test workflow for nvidia compiler

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  bioconda/bioconda-recipes#61168 · 2025年12月6日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Package roary is not installable if channel policy is strict

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  bioconda/bioconda-recipes#61150 · コメント 2 件 · 2025年12月5日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• illumina-interop version

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

  bioconda/bioconda-recipes#61064 · 2025年12月3日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• samtools is not picking up AWS profiles for reading from S3.

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

  bioconda/bioconda-recipes#60985 · 2025年11月28日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Automatically closing issues / PRs due to inactivity?

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

  bioconda/bioconda-utils#1069 · 2025年11月25日 に作成

• mamba search output doesn't match website for old versions of bioconductor-biobase

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

  bioconda/bioconda-recipes#60630 · コメント 1 件 · 2025年11月11日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• macos-13 github runner deprecation and ARM variants

  再び着手できるかも @aliciaaevans が 343 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。 オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  bioconda/bioconda-recipes#60476 · コメント 5 件 · 担当者 1 名 · 2025年11月4日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• Why doesn't installBiocDataPackage.sh support caching?

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 29/100

  bioconda/bioconda-recipes#60369 · コメント 3 件 · 2025年10月30日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信

• bioconda-repodata-patches has incorrect hash in the repodata.json

  オープン

  ⋯この Issue の問題を報告

  • 何か問題がありますか？

  • すでに着手されている
  • 初心者向けではない
  • 古い・無効
  • その他…
  • 送信 キャンセル

  難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 80/100

  bioconda/bioconda-recipes#60009 · コメント 1 件 · 2025年10月11日 に作成

  メンテナーはふだん 2 日以内に返信