bioconda

Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data

• macs2 2.2.9.1 linux-64 builds _2 through _5 reference __log_finite/__exp_finite and fail to import on glibc >= 2.31 (incl. the biocontainers image)

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  bioconda/bioconda-recipes#70217 · Aperta il 13/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• humann 3.9 (noarch) ships its own x86-64 diamond 2.0.15 and bowtie2 2.2.3 in bin/, overwriting its declared run deps

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  bioconda/bioconda-recipes#70213 · Aperta il 13/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• [update] ensembl-vep 116.2 -> 116.3

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  bioconda/bioconda-recipes#70187 · Aperta il 12/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• [update] mrbayes 3.2.8 -> 3.2.9

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  bioconda/bioconda-recipes#70186 · Aperta il 12/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• [update] bioconductor-methylkit 1.36.0 -> 1.38.0

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  bioconda/bioconda-recipes#70185 · Aperta il 12/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• [update] bioconductor-geneselectmmd 2.54.0 -> 2.56.0

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  bioconda/bioconda-recipes#70184 · Aperta il 12/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• [update] gatk4 4.6.2.0 -> 4.7.0.0

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  bioconda/bioconda-recipes#70183 · 1 commento · Aperta il 12/10/2026

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• [update] bioconductor-biovizbase 1.58.0 -> 1.60.0

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  bioconda/bioconda-recipes#70182 · Aperta il 12/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• ucsc-blat 482 (osx-arm64): blat has an invalid code signature and is killed at launch (exit 137)

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  bioconda/bioconda-recipes#70167 · Aperta il 11/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• r-saige 1.3.1: SAIGE.so needs the removed tbb::task API, so library(SAIGE) fails on linux-64 and linux-aarch64

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  bioconda/bioconda-recipes#70035 · Aperta il 8/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Six packages ship x86-64 binaries under linux-aarch64 or noarch; nothing lints ELF arch against subdir

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  bioconda/bioconda-recipes#69811 · 3 commenti · Aperta il 2/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• [broken package] Seqfu has non working versions

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  bioconda/bioconda-recipes#69758 · Aperta il 30/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• package bioconductor-depmap cannot be installed in prefix with spaces

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  bioconda/bioconda-recipes#69522 · Aperta il 22/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Generating PDF report with MAGeCK does not work anymore

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  bioconda/bioconda-recipes#69499 · Aperta il 22/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• repaq xz dependency

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  bioconda/bioconda-recipes#69342 · Aperta il 17/9/2026

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• gnuplot-py 1.8 py3 build ships partially converted code (2to3 aborts silently)

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  bioconda/bioconda-recipes#68921 · Aperta il 8/9/2026

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• pycoqc: h5py=2.9.0 pin is the only thing blocking linux-aarch64

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  bioconda/bioconda-recipes#68793 · 2 commenti · Aperta il 3/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• gtdbtk and comebin pin pplacer =1.1.alpha19, the one version without linux-aarch64

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  bioconda/bioconda-recipes#68792 · 1 commento · Aperta il 3/9/2026

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• gatk4: multi-output split dropped noarch, so gatk4-main/gatk4-spark have no arm64 build

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  bioconda/bioconda-recipes#68791 · Aperta il 3/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• metamdbg: additional-platforms block removed in 1.3, dropping linux-aarch64 and osx-arm64

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  bioconda/bioconda-recipes#68790 · Aperta il 3/9/2026

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• Recipe updates that change source URL to a fork

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  question

  Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 22/100

  bioconda/bioconda-recipes#68715 · Aperta il 2/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Conda-forge migration or dual-channel guidance for dotmatch

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  bioconda/bioconda-recipes#68387 · 3 commenti · Aperta il 22/8/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Bulk update Bioconductor recipes to Bioconductor 3.23 / R 4.6

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  bioconda/bioconda-recipes#68225 · 2 commenti · 1 reazione · Aperta il 17/8/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• [broken package] All native osx-arm64 megahit=1.2.9 builds are broken (AttributeError & Exit -11)

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  bioconda/bioconda-recipes#68074 · Aperta il 11/8/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• [broken package] Multiple osx-64 megahit=1.2.9 builds fail test suite (Exit -6, Exit -11, AttributeError)

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  bioconda/bioconda-recipes#68073 · 1 commento · Aperta il 11/8/2026

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• Suspicious number of downloads for Harpy

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  bioconda/bioconda-recipes#68071 · Aperta il 11/8/2026

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• Bioconda: hmftools wrappers force an unavailable locale

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  bioconda/bioconda-recipes#67947 · Aperta il 7/8/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Pause auto merging of autobumps with proposed changes

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  bioconda/bioconda-recipes#67365 · 1 commento · 2 reazioni · Aperta il 21/7/2026

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• gatk4 openjdk>=17.0 dependency

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  bioconda/bioconda-recipes#66708 · 3 commenti · Aperta il 26/6/2026

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• pygenomeviz 0.4.4 fails to install.

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  bioconda/bioconda-recipes#65137 · 2 commenti · Aperta il 6/5/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• ont-modkit 0.6.2 package contains 0.6.1 binary

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  bioconda/bioconda-recipes#65105 · 1 commento · 1 reazione · Aperta il 5/5/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• sra-human-scrubber includes x86 binary, and isn't really no-arch

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  bioconda/bioconda-recipes#65077 · 1 commento · Aperta il 4/5/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Add Ne2-1L binary on PATH of r-rldne package

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  bioconda/bioconda-recipes#65040 · Aperta il 2/5/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• admixture website has moved, including download link in build script

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  bioconda/bioconda-recipes#64982 · Aperta il 30/4/2026

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• install new Rust stable and nightly

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  bioconda/bioconda-recipes#63328 · 1 commento · Aperta il 7/3/2026

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• Prevent accidentally pushing tags

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  bioconda/bioconda-utils#1078 · Aperta il 11/2/2026

• Request to mark versions 1.2, 1.5, 1.7 of VITAP as broken

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  bioconda/bioconda-recipes#62412 · Aperta il 5/2/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Flagging duplicate pull requests for the same recipe

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  bioconda/bioconda-recipes#61357 · 1 reazione · Aperta il 15/12/2025

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• `ensembl-vep` segmentation fault with macOS arm64

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  bioconda/bioconda-recipes#61335 · 3 commenti · 1 reazione · Aperta il 13/12/2025

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• gatk4 has a pin on python 3.10 that doesn't exist in meta.yml

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  bioconda/bioconda-recipes#61213 · 2 commenti · Aperta il 9/12/2025

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• centos-7 test workflow for nvidia compiler

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  bioconda/bioconda-recipes#61168 · Aperta il 6/12/2025

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Package roary is not installable if channel policy is strict

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  bioconda/bioconda-recipes#61150 · 2 commenti · Aperta il 5/12/2025

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• illumina-interop version

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  bioconda/bioconda-recipes#61064 · Aperta il 3/12/2025

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• samtools is not picking up AWS profiles for reading from S3.

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  bioconda/bioconda-recipes#60985 · Aperta il 28/11/2025

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• Automatically closing issues / PRs due to inactivity?

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  bioconda/bioconda-utils#1069 · Aperta il 25/11/2025

• mamba search output doesn't match website for old versions of bioconductor-biobase

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  bioconda/bioconda-recipes#60630 · 1 commento · Aperta il 11/11/2025

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni

• macos-13 github runner deprecation and ARM variants

  Forse di nuovo libera @aliciaaevans l’ha presa 341 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta

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  bioconda/bioconda-recipes#60476 · 5 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 4/11/2025

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• Why doesn't installBiocDataPackage.sh support caching?

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  bioconda/bioconda-recipes#60369 · 3 commenti · Aperta il 30/10/2025

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• bioconda-repodata-patches has incorrect hash in the repodata.json

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  Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 80/100

  bioconda/bioconda-recipes#60009 · 1 commento · Aperta il 11/10/2025

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• Latest build of package spades 4.2.0 does not run on older CPUs

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  Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

  bioconda/bioconda-recipes#59895 · Aperta il 6/10/2025

  I maintainer di solito rispondono entro 2 giorni