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althonos のリポジトリ

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althonos/mininearPython

A NumPy port of the NEAR code for embedding protein sequences.

最終コミット 2025年9月4日

 (5 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/mocloPython

Modular cloning simulation with the MoClo framework in Python

最終コミット 2022年5月3日

 (12 stars) (2 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/muscleC++

Multiple sequence alignment with top benchmark scores scalable to thousands of sequences. Generates replicate alignments, enabling assessment of downstream analyses such as trees and predicted structures.

最終コミット 2022年3月30日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/nafcodecRust

Rust coder/decoder for Nucleotide Archival Format (NAF) files.

最終コミット 2025年1月31日

 (10 stars) (1 fork) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/nanoset.pyPython

A memory-optimized wrapper for Python sets likely to be empty.

最終コミット 2022年10月12日

 (8 stars) (2 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/nomRust

Rust parser combinator framework

最終コミット 2025年2月24日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/nvidia-gpu-appletPython

GUI for monitoring NVIDIA GPU (adapted from bbswitch-gui)

最終コミット 2024年2月1日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/obofoundry.rsRust

Structures to deserialize OBO Foundry listings into.

最終コミット 2024年9月10日

 (1 star) (1 fork) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/opalC++

SIMD C/C++ library for massive optimal sequence alignment (local/SW, infix, overlap, global)

最終コミット 2015年11月16日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/opticaldiscRust

Read optical media filesystems with Rust

最終コミット 2018年5月9日

 (4 stars) (1 fork) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/pacman-packagesShell

最終コミット 2019年12月5日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/papasmurfRust

A Platform-Accelerated Package for Alignment-free SMURF analysis.

最終コミット 2026年3月16日

 (0 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/peptides.pyPython

Physicochemical properties, indices and descriptors for amino-acid sequences.

最終コミット 2025年9月4日

 (119 stars) (19 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/prontoPython

A Python frontend to (Open Biomedical) Ontologies.

最終コミット 2026年1月13日

 (263 stars) (47 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/property-cachedPython

A (better) decorator for caching properties in classes (forked from cached-property).

最終コミット 2021年6月27日

 (6 stars) (2 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/proteinogenicRust

Chemical structure generation for protein sequences as SMILES string.

最終コミット 2022年3月1日

 (4 stars) (1 fork) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/pruefungRust

Redundancy checks in pure Rust

最終コミット 2021年6月27日

 (5 stars) (2 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/pubchem.rsRust

Rust data structures and client for the PubChem REST API

最終コミット 2022年2月24日

 (14 stars) (1 fork) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/pyabricatePython

Pure Python port and interface to ABRicate, a tool for mass screening of contigs for antimicrobial resistance or virulence genes.

最終コミット 2025年11月4日

 (3 stars) (0 forks) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)
althonos/pyaragornCython

Cython bindings and Python interface to ARAGORN, a (t|mt|tm)RNA gene finder.

最終コミット 2026年3月7日

 (10 stars) (1 fork) (0 件の索引済み issue) (0 件のオープンな good first issue)