Slower `fsetdiff` vs `dplyr::setdiff`
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評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 48/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 静か
- 技術スタック
- r
- 領域
- performance
調査の方向性
Start by reproducing the issue's bench::mark comparison between data.table::fsetdiff and dplyr::setdiff using the supplied data.table inputs. Trace the fsetdiff implementation and compare the relevant work with the benchmarked alternative. Done means preserving fsetdiff's results while measurably reducing its runtime and memory allocation on this example.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
This came up after code profiling where a loop was calling fsetdiff in each pass among other things.
library(data.table)
olddt <- data.table::data.table(a = paste0(1:10000, "a"))
newdt <- data.table::data.table(a = paste0(1:10010, "a"))
bench::mark(DT = data.table::fsetdiff(newdt, olddt),
DPLYR = dplyr::setdiff(newdt, olddt),
min_iterations = 30,
relative = TRUE)[, 1:5]
# A tibble: 2 × 5
expression min median `itr/sec` mem_alloc
<bch:expr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 DT 10.7859 11.0259 1 1.81242
2 DPLYR 1 1 10.0019 1
bench::mark(DT = data.table::fsetdiff(newdt, olddt),
DPLYR = dplyr::setdiff(newdt, olddt),
min_iterations = 30,
relative = FALSE)[, 1:5]
# A tibble: 2 × 5
expression min median `itr/sec` mem_alloc
<bch:expr> <bch:tm> <bch:tm> <dbl> <bch:byt>
1 DT 4.77ms 5.66ms 171.193 763KB
2 DPLYR 432µs 505.4µs 1799.31 421KB
Session info
sessioninfo::session_info()
#> ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
#> setting value
#> version R version 4.5.3 (2026-03-11 ucrt)
#> os Windows 11 x64 (build 26200)
#> system x86_64, mingw32
#> ui RTerm
#> language (EN)
#> collate English_United Kingdom.utf8
#> ctype English_United Kingdom.utf8
#> date 2026-06-07
#>
#> ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
#> package * version date (UTC) lib source
#> bench 1.1.4 2025-01-16 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> cli 3.6.6 2026-04-09 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> data.table * 1.18.4 2026-05-06 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> digest 0.6.39 2025-11-19 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> dplyr 1.2.1 2026-04-03 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> evaluate 1.0.5 2025-08-27 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> fastmap 1.2.0 2024-05-15 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> fs 2.1.0 2026-04-18 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> generics 0.1.4 2025-05-09 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> glue 1.8.1 2026-04-17 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> htmltools 0.5.9 2025-12-04 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> knitr 1.51 2025-12-20 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> lifecycle 1.0.5 2026-01-08 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> magrittr 2.0.5 2026-04-04 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> otel 0.2.0 2025-08-29 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> pillar 1.11.1 2025-09-17 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> pkgconfig 2.0.3 2019-09-22 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> profmem 0.7.0 2025-05-02 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> R6 2.6.1 2025-02-15 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> reprex 2.1.1 2024-07-06 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> rlang 1.2.0 2026-04-06 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> rmarkdown 2.31 2026-03-26 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> rstudioapi 0.18.0 2026-01-16 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> sessioninfo 1.2.4 2026-06-04 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> tibble 3.3.1 2026-01-11 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> tidyselect 1.2.1 2024-03-11 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> utf8 1.2.6 2025-06-08 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> vctrs 0.7.3 2026-04-11 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> withr 3.0.2 2024-10-28 [1] CRAN (R 4.5.2)
#> xfun 0.57 2026-03-20 [1] CRAN (R 4.5.3)
#> yaml 2.3.12 2025-12-10 [1] CRAN (R 4.5.2)
#>
#> [1] C:/Program Files/R/library
#> [3] C:/Program Files/R/R-4.5.3/library
#> * ── Packages attached to the search path.
#>
#> ──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
- 主要言語
- R
- スター
- 3.9k
- フォーク
- 1.1k
- 平均マージ
- 15時間 51分
- マージ済み PR（30日）
- 3
環境構築
このプロジェクトの開発コンテナを、あなたの GitHub アカウントでブラウザ上に起動します。
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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