Heap corruption when printing, if importing pytorch *before* julia
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評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 25/100
調査の方向性
macOS で 2 通りの import 順序を使って最小限の例を再現し、その後 julia/core.py の Julia.eval、_call、check_exception 付近から調査を始めてください。報告された pipe_open EEXIST エラーを追跡し、PyTorch を先に import した場合の挙動と比較してください。この例でヒープが破壊されたり abort したりしなくなれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
I have no idea what this very strange issue comes from. It could be a combination of my specific torch version (tested 1.11-1.13, still occurs), specific operating system (macOS), specific python version (3.8.9) combined with my specific julia version (1.7.2).
Here's a minimal example:
import torch
from julia import Pkg
Pkg.add("StatsBase")
The output is:
Python(61891,0x100598580) malloc: *** error for object 0xffffffff00000000: pointer being freed was not allocated
Python(61891,0x100598580) malloc: *** set a breakpoint in malloc_error_break to debug
signal (6): Abort trap: 6
in expression starting at none:0
__pthread_kill at /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib (unknown line)
Allocations: 11431809 (Pool: 11423282; Big: 8527); GC: 14
[1] 61891 abort ~/venvs/main/bin/ipython
However, I can make this go away with:
from julia import Pkg
import torch
Pkg.add("StatsBase")
This works fine.
I see this more helpful error when I run this code in a debugger:
File ~/venvs/main/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py:621, in Julia.eval(self, src)
619 if src is None:
620 return None
--> 621 ans = self._call(src)
622 if not ans:
623 return None
File ~/venvs/main/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py:549, in Julia._call(self, src)
547 # logger.debug("_call(%s)", src)
548 ans = self.api.jl_eval_string(src.encode('utf-8'))
--> 549 self.check_exception(src)
551 return ans
File ~/venvs/main/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py:603, in Julia.check_exception(self, src)
601 else:
602 exception = sprint(showerror, self._as_pyobj(res))
--> 603 raise JuliaError(u'Exception \'{}\' occurred while calling julia code:\n{}'
604 .format(exception, src))
JuliaError: Exception 'IOError: pipe_open: file already exists (EEXIST)' occurred while calling julia code:
So it seems like perhaps pytorch is taking over one of the pipes for printing from Python?
- 主要言語
- Python
- スター
- 893
- フォーク
- 101
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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