ERROR: LoadError: (2): File not found
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評価
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 初心者へのやさしさ
- 35/100
調査の方向性
src/PubMed/eutils_sql_save.jl:25 から呼び出される src/PubMed/pubmed_sql_utils.jl:482 から始めて、Windows で CSV パスが MySQL にどのように渡されるかを調べてください。示されている Windows セットアップで save_efetch! 呼び出しを再現し、生成されたパスを既存の macOS の動作と比較してください。15 件の記事を Windows でファイルが見つからないエラーなしに保存できれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Hey I am trying to run the following the save.efetch function in Julia v1.4.0. On Windows 10.
When I attempt to run this code:
BioMedQuery.PubMed.save_efetch!(conn, efetch_doc, true, true)
I get the following error:
Saving 15 articles to database
┌ Warning:getindex(df::DataFrame, col_ind::ColumnIndex)is deprecated, usedf[!, col_ind]instead.
│ caller = select_columns(::MySQL.Connection, ::String) at mysql_db_utils.jl:62
└ @ BioMedQuery.DBUtils C:\Users\antho.julia\packages\BioMedQuery\K4kwC\src\DBUtils\mysql_db_utils.jl:62
ERROR: LoadError: (2): File 'C:UsersanthoDocumentsMachine_LearningWork2020-04-17_PubMed_basic.csv' not found (Errcode: 2)
Stacktrace:
[1] execute!(::MySQL.Connection, ::String) at C:\Users\antho.julia\packages\MySQL\R2gKS\src\MySQL.jl:84
[2] db_insert!(::MySQL.Connection, ::Dict{String,DataFrame}, ::String, ::String; verbose::Bool, drop_csv::Bool) at C:\Users\antho.julia\packages\BioMedQuery\K4kwC\src\PubMed\pubmed_sql_utils.jl:482
[3] save_efetch!(::MySQL.Connection, ::XMLElement, ::Bool, ::Bool) at C:\Users\antho.julia\packages\BioMedQuery\K4kwC\src\PubMed\eutils_sql_save.jl:25
[4] create_mysql_pubmed_db(::String, ::String, ::XMLElement) at C:\Users\antho\Documents\Machine_Learning\Work\collect_data.jl:132
[5] main() at C:\Users\antho\Documents\Machine_Learning\Work\collect_data.jl:604
[6] top-level scope at C:\Users\antho\Documents\Machine_Learning\Work\collect_data.jl:627
[7] include(::Module, ::String) at .\Base.jl:377
[8] exec_options(::Base.JLOptions) at .\client.jl:288
[9] _start() at .\client.jl:484
in expression starting at C:\Users\antho\Documents\Machine_Learning\Work\collect_data.jl:627
This code seems to work on MacOS however I have not been able to get this running on Windows.
- 主要言語
- Julia
- スター
- 19
- フォーク
- 9
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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