Partial charges: read every scheme ORCA, Gaussian and NWChem provide, and show them like Mulliken
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評価
調査の方向性
Start by tracing how Mulliken and ESP charges are parsed into the per-atom tables and displayed through data/client/config/PropertyPanelDescriptor.xml. Then add support in the listed order, checking each parser against real ORCA, Gaussian, and NWChem outputs and verifying that the atomic charges sum to the total charge. The issue also proposes a unified scheme selector, comparison table, and comparable colour scales.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Requested for research use (partial charges). Today ECCE reads Mulliken (NWChem, ORCA, Gaussian, MOPAC, ECCE-QM), ESP fits (NWChem esp, Gaussian MK/CHELPG) and ORCA CHELPG when requested. Everything else the codes provide is ignored.
Not read yet
| Scheme | ORCA | Gaussian 16 | NWChem |
|---|---|---|---|
| Löwdin | printed by default | — | printed on request |
| Mayer (atomic charge, bond orders) | printed by default | "Do Mayer BO" offered, output not read | — |
| Hirshfeld | ! Hirshfeld |
Pop=Hirshfeld |
— |
| CM5 | — | with Pop=Hirshfeld |
— |
| MBIS | ! MBIS (ORCA 5+) |
— | — |
| NPA (NBO) | with NBO | Pop=NBO6 already offered, NPA not read |
via NBO's file |
| APT | — | printed with Freq |
— |
Order (cheapest first):
- Read what is printed already: ORCA Löwdin and Mayer, Gaussian NPA (already requestable) and APT.
- Offer and read Hirshfeld (ORCA, Gaussian), CM5 (Gaussian), MBIS (ORCA) in the Calculation Editor.
- NWChem Löwdin; NBO for ORCA and NWChem if the NBO program is available.
Display: the general PartialCharges panel (table, colour scale, atoms coloured by charge; used for ESPCHARGE) can show each new property by declaring it in data/client/config/PropertyPanelDescriptor.xml (group Charges, class PartialCharges), as long as the parse scripts store the same per-atom table. On top of that:
- one "Atomic charges" entry with a scheme choice, instead of one menu entry per scheme;
- a comparison table (atoms × schemes), optionally a plot of charge per atom for each scheme;
- the same, optionally fixed, colour scale across schemes so colours are comparable.
Verification: each scheme checked against a real output of that code (water, a small ion pair, a transition-metal complex), with sums matching the total charge, as in the teaching set.
- 主要言語
- C
- スター
- 10
- フォーク
- 8
- 平均マージ
- 21分
- マージ済み PR（30日）
- 1
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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