DiamondLightSource/Savu

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Tomography Reconstructon Pipeline

スター: 43
フォーク: 42
オープンの初心者向け issue: 0
索引済み issue: 105

主要言語: Python
ライセンス: ライセンスのデータがありません
最終 GitHub push: 2022年8月18日
最新の索引: 2026年9月15日
コントリビューションガイド: コントリビューションガイドがありません
行動規範: 行動規範がありません
初心者向けラベル: help wanted
PR マージ指標: 30日以内にマージされた PR はありません

初心者向けすべて

オープンすべて

オープンの issue を 105 件索引しました

Problem to install Savu inside a Singularity container オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

DiamondLightSource/Savu#939 · 2023年12月20日に作成
Issue when using savu_mpijob_local.sh オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 45/100

DiamondLightSource/Savu#938 · 2023年8月9日に作成
Incorrect dtype in data_full_ring_GH in tomobar_recon_3D_tools.py オープン

難易度 1/5 1時間未満初心者へのやさしさ 68/100

DiamondLightSource/Savu#937 · 2023年8月7日に作成
version of python and numpy オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

DiamondLightSource/Savu#868 · コメント 2 件 · 2021年11月19日に作成
Flake8 output on Savu's py37 repo オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

DiamondLightSource/Savu#692 · コメント 1 件 · 2020年12月9日に作成
Runtime error when running Savu オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

DiamondLightSource/Savu#643 · コメント 12 件 · 2020年2月13日に作成
raw data isn't linked correctly in output dataset オープン

bug low priority

DiamondLightSource/Savu#594 · 担当者 1 名 · 2019年9月24日に作成
Savu automated data cropping/trimming plugin オープン

in progress

DiamondLightSource/Savu#571 · 担当者 1 名 · 2019年6月27日に作成
Report error if users forgot to set "cor" オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 45/100

DiamondLightSource/Savu#565 · 2019年4月18日に作成
Return an error message if using TiffSaver for >=4D dataset オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

DiamondLightSource/Savu#564 · 2019年4月18日に作成
Incompatible PyMca changes オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

DiamondLightSource/Savu#563 · 2019年4月12日に作成
Create install/master_install オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

DiamondLightSource/Savu#560 · 2019年3月29日に作成
you cannot modify GPU configs on machines without a GPU オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

DiamondLightSource/Savu#559 · 2019年3月8日に作成
HDF5 1.10.5 is out with proper OpenMPI support... オープン

in progress

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 20/100

DiamondLightSource/Savu#558 · コメント 3 件 · 2019年3月6日に作成
Savu config should not require a plugin to be executable to add it to a process list オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

DiamondLightSource/Savu#557 · 2019年2月22日に作成
Make it obvious when plugins have missing dependencies オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

DiamondLightSource/Savu#553 · 2019年2月15日に作成
Complex numbers not handled オープン

DiamondLightSource/Savu#526 · 担当者 1 名 · 2018年9月17日に作成
Fix 'savu' in path issue when using Hdf5TemplateLoader オープン

DiamondLightSource/Savu#515 · 担当者 1 名 · 2018年7月4日に作成
Add method to get subset of axis labels for each run or process frames オープン

enhancement

DiamondLightSource/Savu#505 · 担当者 1 名 · 2018年5月2日に作成
Look into patterns and subpatterns オープン

DiamondLightSource/Savu#496 · 担当者 1 名 · 2018年4月6日に作成
Rather than choosing to 'keep' raw data after a plugin see if a future plugin requires it オープン

DiamondLightSource/Savu#495 · 担当者 1 名 · 2018年4月5日に作成
Write a plugin template that shows all the parameter options available オープン

DiamondLightSource/Savu#494 · 担当者 1 名 · 2018年3月23日に作成
Delete output data created in tests オープン

DiamondLightSource/Savu#484 · 担当者 1 名 · 2018年2月19日に作成
Miss-matched data and centre of rotation dimensions in reconstruction オープン

bug

DiamondLightSource/Savu#482 · 担当者 1 名 · 2018年2月1日に作成
Remove conda info pipeline in installer? オープン

DiamondLightSource/Savu#479 · 担当者 1 名 · 2018年1月18日に作成
Data stepping very slow オープン

ready

DiamondLightSource/Savu#467 · 担当者 1 名 · 2017年12月12日に作成
Check hdf5 saver in transport classes オープン

DiamondLightSource/Savu#454 · 担当者 1 名 · 2017年11月9日に作成
Investigate h5py file close error when using random_hdf5_loader オープン

ready

DiamondLightSource/Savu#430 · 担当者 1 名 · 2017年5月19日に作成
Add ITK plugin オープン

DiamondLightSource/Savu#428 · 担当者 1 名 · 2017年5月18日に作成
Add timing information around data get and set and log warnings オープン

DiamondLightSource/Savu#420 · 担当者 1 名 · 2017年5月9日に作成
Run savu from /dls/tmp? to avoid eqw when submitting from local folder オープン

ready

DiamondLightSource/Savu#419 · 担当者 1 名 · 2017年5月9日に作成
Implement get_padded_shape and set_padded_shape in plugin_data class オープン

ready

DiamondLightSource/Savu#414 · 担当者 1 名 · 2017年5月4日に作成
Implement Kaz's float to int conversion scripts as a plugin オープン

ready

DiamondLightSource/Savu#411 · 担当者 1 名 · 2017年5月3日に作成
Create command line tool to copy hdf5 tree and 'fake' data オープン

DiamondLightSource/Savu#405 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2017年4月28日に作成
Change output folder name when using a dummy input file オープン

DiamondLightSource/Savu#403 · 担当者 1 名 · 2017年4月27日に作成
Allow a separate dark OR flat in the nxtomo_loader オープン

DiamondLightSource/Savu#400 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2017年4月27日に作成
Extend random 3d tomo loader to output to a nexus file that can be reloaded by nxtomo_loader オープン

DiamondLightSource/Savu#398 · 担当者 1 名 · 2017年4月26日に作成
Add option to request stats are applied to a previous plugin from within a later plugin オープン

ready

DiamondLightSource/Savu#397 · コメント 3 件 · 担当者 1 名 · 2017年4月26日に作成
Create a stats class to use during a plugin (when data is returning) on request オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

DiamondLightSource/Savu#396 · コメント 1 件 · 2017年4月26日に作成
Add tests for random loader plugins オープン

DiamondLightSource/Savu#395 · 担当者 1 名 · 2017年4月26日に作成
Investigate reducing the logging content with -q オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 20/100

DiamondLightSource/Savu#393 · 2017年4月6日に作成
Create process list for auto-reconstruction and upload to ISPyB オープン

DiamondLightSource/Savu#378 · 担当者 1 名 · 2017年1月10日に作成
Create a run folder for log files that are moved to temporary location オープン

enhancement

DiamondLightSource/Savu#374 · 担当者 1 名 · 2017年1月10日に作成
Provide time analysis of plugins and run オープン

enhancement

DiamondLightSource/Savu#372 · 担当者 1 名 · 2017年1月10日に作成
Add option to pass array of variable COR values as plugin parameter to reconstruction オープン

DiamondLightSource/Savu#371 · コメント 3 件 · 担当者 1 名 · 2017年1月5日に作成
Segfault from multiframes reconstruction オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

DiamondLightSource/Savu#370 · コメント 2 件 · 2017年1月4日に作成
Amend Jenkins build to install savu via conda cloud with facilities flag set to dls オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

DiamondLightSource/Savu#367 · 2016年11月22日に作成
config to give useful stack trace オープン

enhancement

DiamondLightSource/Savu#361 · 担当者 1 名 · 2016年10月28日に作成
Add separate scale value for darks and flats in loader (even for image key data) オープン

DiamondLightSource/Savu#360 · 担当者 1 名 · 2016年10月27日に作成
Add CONTRIBUTING.md オープン

DiamondLightSource/Savu#358 · 担当者 1 名 · 2016年10月24日に作成

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