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誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

  • TagBot trigger issue
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 18/100

    BioJulia/Workflows#11 · コメント 22 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Non-throwing API?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

    BioJulia/BufferIO.jl#43 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Zero-length CIGAR operations are rejected, but the SAM specification allows them
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 70/100

    BioJulia/CIGARStrings.jl#16 ·

  • Transfering ownership tasks
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    BioJulia/KEGGAPI.jl#48 ·

  • Support `MemoryView(::Base.RefValue)`
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/MemoryViews.jl#53 ·

  • `repeat(::BioSequence, -1)` should throw
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    documentation enhancement

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 72/100

    BioJulia/BioSequences.jl#353 · リアクション 1 件 ·

  • Review completeness of copying/indel methods
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement feature request

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

    BioJulia/BioSequences.jl#352 ·

  • Breaking changes for v4
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

    BioJulia/BioSequences.jl#351 · コメント 1 件 ·

  • Back `LongSequence` and `LongSubSeq` by `RefVector`
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

    BioJulia/BioSequences.jl#349 · コメント 1 件 ·

  • We should not have `GeneticCode <: AbstractDict{UInt64, AminoAcid}`
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    breaking

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/BioSequences.jl#347 · コメント 1 件 ·

  • Inform Julia's runtime of the C allocation behaviour
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/LibDeflate.jl#16 ·

  • Libz is deprecated
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 55/100

    BioJulia/BigBed.jl#6 ·

  • Libz is deprecated
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 65/100

    BioJulia/BigWig.jl#3 ·

  • Libz is deprecated
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100

    BioJulia/BBI.jl#6 ·

  • B-ALL data from Thorsson et al. Blood
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

    BioJulia/SingleCellProjections.jl#40 · コメント 8 件 ·

  • Add FormatSpecimens.jl
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/BioTutorials#30 ·

  • Execute Julia code in Markdown
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/BioTutorials#27 · コメント 1 件 ·

  • Add block quotes
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    BioJulia/BioTutorials#26 · 担当者 2 名 ·

  • Add numbers to the headers of tutorials 7, 8, 9
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug Presentation

    BioJulia/BioTutorials#25 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 ·

  • Fix Rosalind tutorial ordering
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug Presentation

    BioJulia/BioTutorials#24 · コメント 1 件 · 担当者 2 名 ·

  • Look into ecosystem health metrics
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/biojulia.github.io#32 · コメント 4 件 ·

  • Add Runic / JET as recommendation for BioJulia packages
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    BioJulia/Contributing#16 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 ·

  • Create API to allow circumventing the buffer altogether?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/BufferIO.jl#36 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Create `write_vectorized` and `read_vectorized`?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/BufferIO.jl#34 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Optional function to write from a pointer and size?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/BufferIO.jl#33 · コメント 5 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • XAM cannot install with GenomicFeatures v3.0.0
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    compat

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

    BioJulia/XAM.jl#80 · コメント 3 件 ·

  • Type erased reader
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/BufferIO.jl#4 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Move to JuliaIO?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 15/100

    BioJulia/BufferIO.jl#2 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • https://github.com/orgs/BioJulia/teams/admins for BioJulia not longer exists
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 55/100

    BioJulia/Contributing#15 · コメント 2 件 ·

  • latest href points to a 404
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 48/100

    BioJulia/Contributing#14 ·

  • Move the recoding trait system from Kmers into BioSequences
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/BioSequences.jl#333 ·

  • FR: DynamicKmer
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/Kmers.jl#50 ·

  • Add more counting methods
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

    BioJulia/Kmers.jl#48 ·

  • Reuse record for multiple readers
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    BioJulia/FASTX.jl#129 ·

  • Residue numbering sensitive to `db_align_beg`?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 32/100

    BioJulia/BioStructures.jl#74 · コメント 5 件 ·

  • Consider using an enum for secondary structure
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    breaking

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

    BioJulia/BioStructures.jl#72 · コメント 1 件 ·

  • Tokenizer fails on 32 bit machines
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

    BioJulia/Automa.jl#140 · コメント 2 件 ·

  • `readgff` fails with protein sequences
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    BioJulia/GenomicAnnotations.jl#20 · コメント 2 件 ·

  • Copy chunks of encoding instead of individual symbols
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    BioJulia/Kmers.jl#38 · リアクション 1 件 ·

  • Discussion: Make `LongSequence` fixed-length?
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    breaking

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/BioSequences.jl#329 · コメント 10 件 ·

  • memory usage when reading (really large) files
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/BioStructures.jl#59 · コメント 6 件 ·

  • Document BioSequence interface(s)
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    BioJulia/BioSequences.jl#328 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 ·

  • Hide inner constructors of objects in this package
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    breaking

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/BioSequences.jl#318 · コメント 1 件 ·

  • File types (inputs and outputs)
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/NCBIBlast.jl#2 ·

  • biojulep: iterators or fold for structures
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/BioStructures.jl#57 · コメント 1 件 ·

  • Support for Concurrent Access with XAM.jl: Reader/Writer Safety and Locking Considerations
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/XAM.jl#76 ·

  • Flat file -> DataMatrix?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/SingleCellProjections.jl#21 · コメント 5 件 ·

  • Last Bed entry not being read
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    BioJulia/BED.jl#25 · コメント 2 件 ·

  • Read sequences don't have overlapping with gene, but eachoverlap() reported there're.
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    BioJulia/XAM.jl#75 · コメント 5 件 ·

  • Cross compatibility with XAM.jl?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    BioJulia/BED.jl#24 · コメント 2 件 ·

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