Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

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BioJulia

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  • TagBot trigger issue
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 18/100

    BioJulia/Workflows#11 · 22 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Non-throwing API?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    BioJulia/BufferIO.jl#43 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Zero-length CIGAR operations are rejected, but the SAM specification allows them
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 70/100

    BioJulia/CIGARStrings.jl#16 ·

  • Transfering ownership tasks
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

    BioJulia/KEGGAPI.jl#48 ·

  • Support `MemoryView(::Base.RefValue)`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/MemoryViews.jl#53 ·

  • `repeat(::BioSequence, -1)` should throw
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    documentation enhancement

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 72/100

    BioJulia/BioSequences.jl#353 · 1 reacción ·

  • Review completeness of copying/indel methods
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement feature request

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

    BioJulia/BioSequences.jl#352 ·

  • Breaking changes for v4
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    BioJulia/BioSequences.jl#351 · 1 comentario ·

  • Back `LongSequence` and `LongSubSeq` by `RefVector`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

    BioJulia/BioSequences.jl#349 · 1 comentario ·

  • We should not have `GeneticCode <: AbstractDict{UInt64, AminoAcid}`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    breaking

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/BioSequences.jl#347 · 1 comentario ·

  • Inform Julia's runtime of the C allocation behaviour
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/LibDeflate.jl#16 ·

  • Libz is deprecated
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

    BioJulia/BigBed.jl#6 ·

  • Libz is deprecated
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 65/100

    BioJulia/BigWig.jl#3 ·

  • Libz is deprecated
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

    BioJulia/BBI.jl#6 ·

  • B-ALL data from Thorsson et al. Blood
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

    BioJulia/SingleCellProjections.jl#40 · 8 comentarios ·

  • Add FormatSpecimens.jl
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/BioTutorials#30 ·

  • Execute Julia code in Markdown
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/BioTutorials#27 · 1 comentario ·

  • Add block quotes
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    BioJulia/BioTutorials#26 · 2 asignados ·

  • Add numbers to the headers of tutorials 7, 8, 9
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug Presentation

    BioJulia/BioTutorials#25 · 1 comentario · 1 asignado ·

  • Fix Rosalind tutorial ordering
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug Presentation

    BioJulia/BioTutorials#24 · 1 comentario · 2 asignados ·

  • Look into ecosystem health metrics
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/biojulia.github.io#32 · 4 comentarios ·

  • Add Runic / JET as recommendation for BioJulia packages
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    BioJulia/Contributing#16 · 1 comentario · 1 asignado ·

  • Create API to allow circumventing the buffer altogether?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/BufferIO.jl#36 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Create `write_vectorized` and `read_vectorized`?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/BufferIO.jl#34 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Optional function to write from a pointer and size?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/BufferIO.jl#33 · 5 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • XAM cannot install with GenomicFeatures v3.0.0
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    compat

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 38/100

    BioJulia/XAM.jl#80 · 3 comentarios ·

  • Type erased reader
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/BufferIO.jl#4 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Move to JuliaIO?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    BioJulia/BufferIO.jl#2 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • https://github.com/orgs/BioJulia/teams/admins for BioJulia not longer exists
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 55/100

    BioJulia/Contributing#15 · 2 comentarios ·

  • latest href points to a 404
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 48/100

    BioJulia/Contributing#14 ·

  • Move the recoding trait system from Kmers into BioSequences
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/BioSequences.jl#333 ·

  • FR: DynamicKmer
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/Kmers.jl#50 ·

  • Add more counting methods
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

    BioJulia/Kmers.jl#48 ·

  • Reuse record for multiple readers
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

    BioJulia/FASTX.jl#129 ·

  • Residue numbering sensitive to `db_align_beg`?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 32/100

    BioJulia/BioStructures.jl#74 · 5 comentarios ·

  • Consider using an enum for secondary structure
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    breaking

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

    BioJulia/BioStructures.jl#72 · 1 comentario ·

  • Tokenizer fails on 32 bit machines
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

    BioJulia/Automa.jl#140 · 2 comentarios ·

  • `readgff` fails with protein sequences
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    BioJulia/GenomicAnnotations.jl#20 · 2 comentarios ·

  • Copy chunks of encoding instead of individual symbols
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    BioJulia/Kmers.jl#38 · 1 reacción ·

  • Discussion: Make `LongSequence` fixed-length?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    breaking

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/BioSequences.jl#329 · 10 comentarios ·

  • memory usage when reading (really large) files
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/BioStructures.jl#59 · 6 comentarios ·

  • Document BioSequence interface(s)
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    BioJulia/BioSequences.jl#328 · 1 comentario · 1 asignado ·

  • Hide inner constructors of objects in this package
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    breaking

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/BioSequences.jl#318 · 1 comentario ·

  • File types (inputs and outputs)
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/NCBIBlast.jl#2 ·

  • biojulep: iterators or fold for structures
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/BioStructures.jl#57 · 1 comentario ·

  • Support for Concurrent Access with XAM.jl: Reader/Writer Safety and Locking Considerations
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    question

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/XAM.jl#76 ·

  • Flat file -> DataMatrix?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/SingleCellProjections.jl#21 · 5 comentarios ·

  • Last Bed entry not being read
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    BioJulia/BED.jl#25 · 2 comentarios ·

  • Read sequences don't have overlapping with gene, but eachoverlap() reported there're.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    BioJulia/XAM.jl#75 · 5 comentarios ·

  • Cross compatibility with XAM.jl?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    BioJulia/BED.jl#24 · 2 comentarios ·

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