AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis

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An open, collaborative project to analyze data from the Single-cell Pediatric Cancer Atlas (ScPCA) Portal

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis は初心者に優しい？

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis への外部コントリビューターの PR が最近は少なく、どのくらいマージされるかはまだ言えません。初心者向けの issue が現在 2 件オープンです。

スター: 16
フォーク: 24
オープンの初心者向け issue: 2
索引済み issue: 47
平均マージ: 7日 7分
マージ済み PR（30日）: 1

主要言語: HTML
ライセンス: ライセンスのデータがありません
最終 GitHub push: 2026年10月13日
最新の索引: 2026年9月14日
コントリビューションガイド: コントリビューションガイド
行動規範: 行動規範
初心者向けラベル: 初心者向けラベルは索引されていません

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis にコントリビュートするには

まずコントリビューションガイドを読みましょう。変更の提案、テスト、レビューの進め方が書かれています。
行動規範も読んでおきましょう。チャットだけでなく issue や PR にも適用されます。
下にある 2 件の初心者向けのオープンな issue から 1 つ選び、作業を始める前に取り組みたいとコメントしましょう。

初心者向けすべて

オープンすべて

誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。すべて日付順に表示

Create a release: 2026-10-05
オープン
- 何か問題がありますか？
release

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 48/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1437 · 2026年10月5日に作成
Monthly spellcheck results
オープン
- 何か問題がありますか？
OpenScPCA admin spelling

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 72/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1434 · 2026年9月15日に作成
Evaluate reference approach for annotating osteosarcoma samples
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1424 · コメント 1 件 · 2026年8月3日に作成
Add script to train SingleR model
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1414 · 2026年7月6日に作成
Add script to prepare references for use
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1413 · コメント 1 件 · 2026年7月6日に作成
Update immune cell types file in `cell-type-consensus`
再び着手できるかも @allyhawkins が 262 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。オープン
- 何か問題がありますか？
AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1391 · 担当者 1 名 · 2026年2月5日に作成
Don't recommend use of osx-64 platform for conda-lock
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 65/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1244 · コメント 1 件 · 2025年7月30日に作成
Record project-specific normal reference groups in TSVs
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 42/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1239 · 2025年7月28日に作成
Osteosarcoma SCPCAB0027 - Tumor versus Normal cell differentiation and annotation
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1193 · 2025年7月2日に作成
Add function to create total CNV column
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 48/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1157 · 2025年6月3日に作成
Use CNV distributions to identify additional Ewings tumor cells
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 30/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1156 · 2025年6月3日に作成
Run inferCNV on neuroblastoma samples
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1148 · 2025年6月2日に作成
Explore use of pooled normal reference with inferCNV in solid tumors of interest
オープン
- 何か問題がありますか？
Epic

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1143 · 2025年6月2日に作成
Add wrapper function for running internal references
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 42/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1130 · 2025年5月15日に作成
Pilocytic Astrocytoma scRNA Analysis
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1121 · 2025年5月7日に作成
Docs request: Centralized documentation for available results
オープン
- 何か問題がありますか？
OpenScPCA admin

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1119 · 2025年5月6日に作成
Explore cells that are classified as both immune and tumor in Ewing samples
再び着手できるかも @allyhawkins が 584 日前に担当しましたが、オープン中のプルリクエストはありません。オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#1087 · 担当者 1 名 · 2025年3月20日に作成
Consider using a converted Seurat object in hello-clusters
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#957 · コメント 1 件 · 2024年12月20日に作成
Docs request: "Quick start" guide for technical setup
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#948 · コメント 1 件 · 2024年12月17日に作成
Notebook to explore using normal cell references to annotate tumor cell states in Ewing sarcoma samples
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#941 · 2024年12月13日に作成
Decrease size of docker image for Ewing's module
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#884 · コメント 4 件 · 2024年11月15日に作成
Integration of the SCPCP000006 Wilms tumor dataset
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#857 · コメント 7 件 · 2024年11月5日に作成
Improve Wilms Tumor Dataset Annotation (SCPCP000006) - explore `predicted.score` and `has_cnv.score` thresholds
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#856 · コメント 5 件 · 2024年11月5日に作成
Modify/explore clustering for Wilms tumor annotation (SCPCP000014)
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#840 · 2024年10月24日に作成
Docs request: FAQ about gene id conversion
オープン
- 何か問題がありますか？
難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#837 · コメント 1 件 · 2024年10月22日に作成
cell type/tumor annotation for ETP T-ALL (SCPCP000003)
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#822 · 2024年10月16日に作成
Attempt to identify tumor cells in those non-ETP samples without B cells (SCPCP000003)
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#811 · 2024年10月15日に作成
Keep tabs on Rhtslib installation in Dockerfiles
オープン
- 何か問題がありますか？
OpenScPCA admin

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#803 · 2024年10月8日に作成
celltype/tumor annotation for non-ETP T-ALL (SCPCP000003)
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#787 · 2024年10月1日に作成
Initiation of SCPCP000001
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 30/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#778 · コメント 5 件 · 2024年9月24日に作成
Celltype annotation for non-ETP ALL (SCPCP000003)
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#761 · 2024年9月13日に作成
DSRCT Dataset Analysis (SCPCP000013) #583
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 30/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#701 · コメント 1 件 · 2024年8月7日に作成
Cell Type Annotation of Osteosarcoma snRNA-seq Data (SCPCP000017)
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#687 · コメント 1 件 · 2024年8月3日に作成
Future idea: Use SingleR with SCPCL000822 and SCPCL000824 as references to annotate remaining Ewing samples
オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#668 · 2024年7月25日に作成
Additional docs for troubleshooting precommit
オープン
- 何か問題がありますか？
documentation

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#645 · 2024年7月23日に作成
Docs request: Organizing your module results
オープン
- 何か問題がありますか？
documentation

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#502 · コメント 1 件 · 2024年6月5日に作成
Docs request: Reframe the "running an analysis module" doc
オープン
- 何か問題がありますか？
documentation

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 30/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#475 · コメント 2 件 · 2024年5月31日に作成
Consider adding option to the data download script to list files
オープン
- 何か問題がありますか？
OpenScPCA admin

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#414 · 2024年5月6日に作成
Expand troubleshooting documentation
オープン
- 何か問題がありますか？
documentation

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#299 · コメント 1 件 · 2024年3月27日に作成
[Optional] Doc: What happens after you file a PR?
オープン
- 何か問題がありますか？
documentation

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#210 · 2024年3月18日に作成
Doc: Ways to contribute
オープン
- 何か問題がありますか？
documentation

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#147 · 2024年3月11日に作成
Bug report: Zellkonverter/Basilisk initialization in Docker images doesn't work with rstudio users
対応中かもこのイシューにリンクされたプルリクエストがオープン中、またはマージ済みです。オープン
- 何か問題がありますか？
bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 38/100

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#972 · 2025年1月3日に作成
Exploratory analysis notebook for SEACells
対応中かも @jashapiro が 832 日前に担当しました。オープン
- 何か問題がありますか？
analysis

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis#611 · 担当者 1 名 · 2024年7月15日に作成

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis は初心者に優しい？

AlexsLemonade/OpenScPCA-analysis にコントリビュートするには

何か問題がありますか？

何か問題がありますか？

何か問題がありますか？

何か問題がありますか？

何か問題がありますか？

何か問題がありますか？

何か問題がありますか？

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