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vmikk

3 repository indicizzati · Vedi su GitHub

metagMisc
Miscellaneous functions for metagenomic analysis.

R · 53 stelle
NextITS
A pipeline for metabarcoding fungi and other eukaryotes with full-length ITS sequenced with PacBio

R · 14 stelle
eutax
Backend for taxonomic annotation UI

Python · 0 stelle

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

rename issue in nextflow Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

vmikk/NextITS#16 · 1 commento · Aperta il 20/8/2026
CRAN/Bioconductor Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

vmikk/metagMisc#37 · 1 commento · Aperta il 7/6/2026
Error in do.ply(i) : task 1 failed - "object '.Random.seed' not found" Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

vmikk/metagMisc#36 · 9 commenti · Aperta il 9/4/2026
TO DO Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 20/100

vmikk/eutax#1 · Aperta il 9/12/2025
Running with ITS region set to ITS1_5.8S_ITS2 fails on documentation step Aperta

bug

vmikk/NextITS#13 · 7 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 26/10/2025
Strata argument from adonis2 can't be added Aperta

enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

vmikk/metagMisc#33 · 1 commento · Aperta il 20/6/2024
secondary analysis Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

vmikk/NextITS#5 · 8 commenti · Aperta il 17/4/2024
Rewrite functions using `data.table` Aperta

enhancement

vmikk/metagMisc#21 · 1 assegnatario · Aperta il 17/11/2021
`dissimilarity_to_distance` - error if number of OTUs > number of samples Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

vmikk/metagMisc#15 · Aperta il 11/8/2020
Implement robust alternative to SES Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

vmikk/metagMisc#9 · Aperta il 4/10/2019
Efficient rarefaction Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

vmikk/metagMisc#5 · 1 commento · Aperta il 20/6/2018
Purrr vs Plyr Aperta

enhancement question

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

vmikk/metagMisc#4 · 1 commento · Aperta il 15/11/2017
Parallelize plyr-dependent functions Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

vmikk/metagMisc#1 · 1 commento · Aperta il 24/3/2017

vmikk

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