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metagMisc
Miscellaneous functions for metagenomic analysis.

R · 53 estrellas
NextITS
A pipeline for metabarcoding fungi and other eukaryotes with full-length ITS sequenced with PacBio

R · 14 estrellas
eutax
Backend for taxonomic annotation UI

Python · 0 estrellas

Para principiantes Todo

Abierto Todos

rename issue in nextflow Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

vmikk/NextITS#16 · 1 comentario · Abierto el 20/8/2026
CRAN/Bioconductor Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vmikk/metagMisc#37 · 1 comentario · Abierto el 7/6/2026
Error in do.ply(i) : task 1 failed - "object '.Random.seed' not found" Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

vmikk/metagMisc#36 · 9 comentarios · Abierto el 9/4/2026
TO DO Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 20/100

vmikk/eutax#1 · Abierto el 9/12/2025
Running with ITS region set to ITS1_5.8S_ITS2 fails on documentation step Abierto

bug

vmikk/NextITS#13 · 7 comentarios · 1 asignado · Abierto el 26/10/2025
Strata argument from adonis2 can't be added Abierto

enhancement

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

vmikk/metagMisc#33 · 1 comentario · Abierto el 20/6/2024
secondary analysis Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

vmikk/NextITS#5 · 8 comentarios · Abierto el 17/4/2024
Rewrite functions using `data.table` Abierto

enhancement

vmikk/metagMisc#21 · 1 asignado · Abierto el 17/11/2021
`dissimilarity_to_distance` - error if number of OTUs > number of samples Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

vmikk/metagMisc#15 · Abierto el 11/8/2020
Implement robust alternative to SES Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

vmikk/metagMisc#9 · Abierto el 4/10/2019
Efficient rarefaction Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100

vmikk/metagMisc#5 · 1 comentario · Abierto el 20/6/2018
Purrr vs Plyr Abierto

enhancement question

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

vmikk/metagMisc#4 · 1 comentario · Abierto el 15/11/2017
Parallelize plyr-dependent functions Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

vmikk/metagMisc#1 · 1 comentario · Abierto el 24/3/2017

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