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CmdStan User's guide - sampler auxiliary output file option `diagnostic-file` needs more doc

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Documentazione
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
tex
Ambito
documentation

Direzione di ricerca

Inizia dalla sezione di CmdStan User's guide che tratta le opzioni di output dei campioni, quindi confronta l'output del file diagnostico con la descrizione di output.csv. Documenta la differenza tra CmdStan diagnose, il metodo diagnose del sampler Stan e diagnostic-file, includendo la configurazione condivisa, le intestazioni, le informazioni sui tempi e le colonne dello stato del sampler, nonché le informazioni sull'adattamento presenti esclusivamente in output.csv.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

The CmdStan documentation should say a bit more about the output diagnostic-file option.
The sample methods use the output option diagnostic-file to designate files which contain the per-draw gradients of all parameters.
This is a .csv file, almost like the output file option's Stan CSV file (default name output.csv).

  • Explain difference between CmdStan utility diagnose, Stan sampler method diagnose, and output diagnostics-file.

  • Document the format of the output diagnostics-file - compare to output file=output.csv file:

    • Both files have config, header-rows, and timing.
    • The first columns of the data tables are the sampler state variables, lp__, accept_stat__, etc.
    • Only the output.csv file has adaptation information (as a comment following the data table header row)
Lingua principale
TeX
Stelle
43
Fork
133
Merge medio
11h 32m
PR unite (30g)
4

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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