id for each chain should be unique in multi chain output csvs

Aperta
  • Qualcosa non va?
#1,257 2 commenti 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
cpp
Ambito
cli

Direzione di ricerca

Riproduci il problema con l’esempio bernoulli e due chains usando i comandi indicati nel report. Inizia tracciando la chiamata a parser.print menzionata in Additional Information e il codice che scrive i metadati del CSV di output; il lavoro è completato quando il CSV di ogni chain riporta il proprio id distinto, incluso model_2.csv che mostra id = 2.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Summary:

Right now the id for each chain will always be the same in the output csv, but they should be different for each output file

Description:

Describe the issue as clearly as possible.

Reproducible Steps:
make examples/bernoulli/bernoulli
./examples/bernoulli/bernoulli sample num_chains=2 data file="./examples/bernoulli/bernoulli.data.R"
Current Output:

For model_2.csv as an example

# stan_version_major = 2
# stan_version_minor = 34
# stan_version_patch = 1
# model = bernoulli_model
# start_datetime = 2024-03-14 19:00:54 UTC
# method = sample (Default)
#   sample
#     num_samples = 1000 (Default)
#     num_warmup = 1000 (Default)
#     save_warmup = 0 (Default)
#     thin = 1 (Default)
#     adapt
#       engaged = 1 (Default)
#       gamma = 0.05 (Default)
#       delta = 0.8 (Default)
#       kappa = 0.75 (Default)
#       t0 = 10 (Default)
#       init_buffer = 75 (Default)
#       term_buffer = 50 (Default)
#       window = 25 (Default)
#       save_metric = 0 (Default)
#     algorithm = hmc (Default)
#       hmc
#         engine = nuts (Default)
#           nuts
#             max_depth = 10 (Default)
#         metric = diag_e (Default)
#         metric_file =  (Default)
#         stepsize = 1 (Default)
#         stepsize_jitter = 0 (Default)
#     num_chains = 2
# id = 1 (Default)
# data
Expected Output:

For model_2.csv

# stan_version_major = 2
# stan_version_minor = 34
# stan_version_patch = 1
# model = bernoulli_model
# start_datetime = 2024-03-14 19:00:54 UTC
# method = sample (Default)
#   sample
#     num_samples = 1000 (Default)
#     num_warmup = 1000 (Default)
#     save_warmup = 0 (Default)
#     thin = 1 (Default)
#     adapt
#       engaged = 1 (Default)
#       gamma = 0.05 (Default)
#       delta = 0.8 (Default)
#       kappa = 0.75 (Default)
#       t0 = 10 (Default)
#       init_buffer = 75 (Default)
#       term_buffer = 50 (Default)
#       window = 25 (Default)
#       save_metric = 0 (Default)
#     algorithm = hmc (Default)
#       hmc
#         engine = nuts (Default)
#           nuts
#             max_depth = 10 (Default)
#         metric = diag_e (Default)
#         metric_file =  (Default)
#         stepsize = 1 (Default)
#         stepsize_jitter = 0 (Default)
#     num_chains = 2
# id = 2
# data
Additional Information:

I swear I did this in the past, but I think what we need to do is pass an iterator for the chain number to parser.print so that when that function is printing the id we can override the value to be the chain id from within the stan program

Current Version:

v2.34.1

Lingua principale
C++
Stelle
240
Fork
105
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di stan-dev/cmdstan

Tutte le issue di stan-dev/cmdstan

Issue simili

Altre issue su C++

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.