Integrate into scanpy and anndata
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 35/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
La issue non indica alcun file o test. Inizia individuando asarray, sum e axis_sum, quindi confronta il loro comportamento con le differenze di integrazione indicate per scanpy e anndata; il lavoro è completato quando le lacune di compatibilità elencate sono state affrontate e verificate.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Current differences:
asarrayusesto_denseinternally forcs{cr}_{matrix,array}asarraysupportszarr(#2)asarrayoperates on a protocolOutOfCoreDatasetdefined by ato_memorymethod instead of the concrete classBaseCompressedSparseDataset(#4)
sum/axis_sum
- returns
np.ndarrayseven when passing in acs{rc}_matrix
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 15
- Fork
- 5
- Merge medio
- 14h 52m
- PR unite (30g)
- 13
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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