rrwick/Badread

Vedi su GitHub

a long read simulator that can imitate many types of read problems

Stelle: 302
Fork: 25
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 11

Lingua principale: Python
Licenza: GPL-3.0
Ultimo push su GitHub: 24/7/2026
Ultima indicizzazione: 20/9/2026
Guida per i contributori: Guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata
Metriche di merge delle PR: Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Coordinate system BadRead Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

rrwick/Badread#40 · 1 commento · Aperta il 24/4/2026
How to handle PacBio simulated reads before mapping Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

rrwick/Badread#31 · 2 commenti · Aperta il 3/4/2024
Documentation on post processing of simulated sequences Aperta

enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

rrwick/Badread#22 · 1 commento · Aperta il 19/4/2023
High Memory consumption causes computer to freeze Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

rrwick/Badread#21 · Aperta il 15/2/2023
Question about --glitches Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

rrwick/Badread#16 · Aperta il 17/6/2021
ModuleNotFoundError: No module named 'edlib' Aperta

bug

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

rrwick/Badread#15 · 1 commento · 4 reazioni · Aperta il 6/1/2021
Organelle genome simulation Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

rrwick/Badread#14 · Aperta il 6/10/2020
Can we give error percentage while simualting Oxford nanopore long reads Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

rrwick/Badread#12 · Aperta il 22/7/2020
What if we could generate two datasets with same reads, one with good quality and one with bad quality? Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

rrwick/Badread#11 · Aperta il 8/5/2020
Can chimeras be formed without adapter sequences? Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

rrwick/Badread#8 · 1 reazione · Aperta il 26/12/2019
Multi-threading Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

rrwick/Badread#7 · 4 commenti · Aperta il 26/9/2019

rrwick/Badread

Ricevi le nuove issue nella tua casella