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Hiding formal charges

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
javascript
Ambito
frontend

Direzione di ricerca

Start with the RDKit.js molecule rendering API and the existing includeRadicals option described in the issue. Trace how display options affect formal charges, then verify that a hideFormalCharge-style option can suppress charge labels without requiring modified input SMILES.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

I'm using RDKit.js to generate semi-randomized structures for my organic chemistry students, to generate practice problems for filling in lone pairs and/or formal charges to structures (assuming filled octets). Currently, this requires using SMILES strings that have been tweaked to generate radicals, which can be hidden by setting includeRadicals to false. This works great for generating structures for anions, but there's no corresponding trick for cations:

Screenshot 2023-11-15 at 10-24-32 RDKit js - JavaScript Example

Since radicals can be hidden, would it be possible to also add an option to hide formal charges (hideFormalCharge, perhaps) as well? That way, the input SMILES wouldn't need any tricks to display with no charges (for example, like this):

Screenshot 2023-11-15 at 10-26-15 RDKit js - JavaScript Example

I realize this is somewhat of a niche use case, but it would be very helpful! I appreciate the consideration.

Lingua principale
SCSS
Stelle
251
Fork
47
Merge medio
4m
PR unite (30g)
4

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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