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Kaplan-Meier curve transform

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#2,144 1 commento 1 reazione 0 assegnatari Vedi su GitHub

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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
30/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
javascript
Ambito
data-visualization

Direzione di ricerca

Inizia leggendo la famiglia Plot.map citata nell’issue e confrontala con l’approssimazione JavaScript fornita. Definisci come una trasformazione Kaplan-Meier debba gestire le lunghezze dei casi nulle, i valori cumulativi e le curve a gradini. Il lavoro è completato quando l’API concordata supporta il comportamento richiesto della curva Kaplan-Meier e corrisponde al risultato previsto dall’esempio.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement

It would be great to have support of kaplan-meier curve, perhaps in the Plot.map family.

As the curve is basically a cumulative sum with some transformations, it shouldn't be too hard.

This code gives a pretty good approxmation:

const caseLength = [{ case_length: 1 }, { case_length: 11 }, { case_length: null }]

Plot.plot({
  y: { transform: (d) => 100 - d * 100 },
  marks: [
    Plot.ruleY([1]), // we want a rule at 0% but it will get flipped by the transform
    Plot.line(
      caseLength,
      Plot.normalizeY(
        (arr) => arr.length,
        Plot.mapY("cumsum", {
          x: "case_length",
          y: (d) => (d.case_length === null ? 0 : 1),
          curve: "step-before"
        })
      )
    )
  ]
})

If interested, I can work on something that extends Plot.map

Lingua principale
HTML
Stelle
5.4k
Fork
246
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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