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fix: RCeattle `convert_output`

Aperta
#400 1 commento 0 reazioni 1 assegnatario Vedi su GitHub

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

@Schiano-NOAA ci sta già lavorando.

Dal 8/10/2026.

  • #401 di @grantdadams — aperta

Valutazione

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Descrizione

Possible changes in RCeattle output objects break convert_output. Resulting error message is: Error in extract_list[[names(extract[[1]][i])]] <- df : attempt to select less than one element in OneIndex.

Rceattle::GOApollock$styr = 1977 # The SAFE model starts at 1970, so change styr to 1970 to run the full time series model (data is in there). I start them all at 1977 because thats the years with overlap.
pollock_model <- Rceattle::fit_mod(
  data_list = Rceattle::GOApollock,
  inits = NULL, # Initial parameters = 0
  file = NULL, # Don't save
  estimateMode = 0, # 0 = Estimate, 1 = Dont run estimation
  random_rec = FALSE, # No random recruitment
  msmMode = 0, # 0 = Single species mode, 1 = MSVPA multi-species mode
  verbose = 1, # Silence optimization output
  phase = TRUE) # Use default phasing

stockplotr::convert_output(pollock_model) # this throws an error
Lingua principale
R
Stelle
20
Fork
8
Merge medio
23h 33m
PR unite (30g)
9

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