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Implementing new recruitment dev vector approach

Aperta
#37 13 commenti 0 reazioni 1 assegnatario Vedi su GitHub

@kellijohnson-NOAA ci sta già lavorando.

Dal 5/11/2020.

Valutazione

Questa issue non è ancora stata valutata.

Descrizione

essay topic recruitment

Imported from redmine, Issue #57889
Opened by @RickMethot on 2018-11-23
Status when imported: In Progress

create new recruitment deviation vector approach
do_recdev==3

With this approach:
exp_rec(y,4) = R0_adj * mfexp(dev(y))
where R0_adj is R0 adjusted for blocks, etc. on R0;
and dev(y) is a simple vector of unconstrained deviations

Then in the objective function:
rather than getting the -logL from the dev vector, now create a new deviation which is dev=log(exp_rec(y,3)/exp_rec(y,4));
where exp_rec(y,4) is shown above and exp_rec(y,3) is the expected value of recruitment adjusted for spawn_recr curve, regimes and env, and bias-adjustment.

Initial test shows that the -logL is about same as using do_recrdev==2 which is simple devs in which exp_rec(y,4) = exp_rec(y,3) * mfexp(dev(y))

Lingua principale
C++
Stelle
46
Fork
19
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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