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modkit-0.6.4 :: help misses some Commands description

Chiusa Adatta ai principianti
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@integral-830 ci sta già lavorando.

Dal 14/10/2026.

Valutazione

Difficoltà
2/5
Tempo stimato
1-3 ore
Idoneità per principianti
70/100
Tipo di issue
Documentazione
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Attiva
Stack tecnologico
cli, rust
Ambito
cli

Direzione di ricerca

L'output di aiuto proviene dalle definizioni degli argomenti da riga di comando, dove ogni sottocomando è dichiarato come variante di un enum Rust. Esegui modkit --help e confronta l'output con i sottocomandi elencati nell'issue, poi verifica se quelli mancanti sono nascosti o esclusi dall'enum. Il lavoro è completo quando i comandi elencati corrispondono a quelli che funzionano ancora, oppure quando i maintainer hanno confermato quali comandi legacy devono restare nascosti. L'issue non dice se aggiungere i comandi all'help o nasconderli deliberatamente, quindi va chiarito prima questo punto.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Hello,

modkit --help display an inclomplete set of available commands.
it documents the following ones

pileup
extract
dmr
pileup-hemi
validate
motif
entropy
localise
stats
bedmethyl
modbam
open-chromatin

but some previous commands not documented in help section are still functionnal eg:

adjust-mods
update-tags
sample-probs
summary
call-mods
repair

regards

Eric

Lingua principale
Rust
Stelle
278
Fork
34
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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