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Very slow training

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
20/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python

Direzione di ricerca

Non sono indicati file, test o punti di ingresso. Inizia riproducendo l'addestramento sul dataset DGL del grafo da 5K descritto e profilando il lavoro della CPU rispetto all'utilizzo della GPU; il lavoro è completato quando viene identificato uno specifico collo di bottiglia della CPU e viene dimostrato un addestramento più veloce, oppure viene documentato chiaramente il passaggio limitante.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

I am training graphormer-slim on a custom dataset with 5K graphs and the loss is coming down nicely. However, the GPU utilization is close to zero while the CPU processes (16) are very busy, which means that the CPU is the bottleneck and I could be training much faster...

Is there anyway to make the CPU side faster?

details:
graphs in DGL format
50-100 nodes per graph
1-3 edges per node

Lingua principale
Python
Stelle
2.5k
Fork
374
Merge medio
14h 51m
PR unite (30g)
3

Preparare l'ambiente

Non abbiamo ancora controllato i file di configurazione di questo progetto. Parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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