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Bwa-mem issues

Aperta
  • Qualcosa non va?
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Ambito
tooling

Direzione di ricerca

Inizia esaminando la gestione delle espressioni regolari di stderr per gli indici mancanti e la logica di costruzione del dataset di output. Confronta il file loc nella directory del data manager con il file loc nella directory del tool, quindi determina se l'impostazione del dataset mancante appartiene al tool o al framework. Il lavoro è completato quando il caso di indice mancante segnala correttamente il fallimento e il dataset di output viene impostato in modo coerente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

bug
  • stderr regex is less than ideal—a missing index gives a "fail" message but the job succeeds
  • the output dataset build is not set when there is an entry in the loc file in the data manager directory but not in the loc file in the tool directory—this may be a framework issue.
Lingua principale
Python
Stelle
37
Fork
94
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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