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samtools_mpileup fails when optional tag set is used

Aperta
#219 1 commento 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
30/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Ambito
tooling

Direzione di ricerca

Inizia con la versione di ToolShed collegata nel report e riproduci il problema selezionando una qualsiasi casella di controllo sotto “Optional tags to output”, lasciando le altre opzioni del modulo ai valori predefiniti. Confronta questa esecuzione con l’invio del modulo con le opzioni predefinite; il problema è risolto quando la selezione di tag opzionali non produce più il codice di uscita 1.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Error is: Fatal error: Exit code 1 (Error)

Trigger: Checking any boxes for the form option "Optional tags to output" (rest of form at default)

Observed on: http://usegalaxy.org

Version: https://toolshed.g2.bx.psu.edu/view/devteam/samtools_mpileup/aa0ef6f0ee89

From Trello: https://trello.com/c/cYkUbipj

Lingua principale
Python
Stelle
37
Fork
94
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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