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Investigate integrating with DuckDB/Object storage vs. postgres requirement

Aperta
#600 1 commento 0 reazioni 1 assegnatario Vedi su GitHub

@theferrit32 ci sta già lavorando.

Dal 15/4/2026.

Valutazione

Questa issue non è ancora stata valutata.

Descrizione

v3

@theferrit32 is putting together code that will allow seqrepo to use DuckDB over blob storage as opposed to postgres. Similar could be done for UTA. This will ease adoption and lower the administrative costs of maintaining seqrepo/UTA reference sequences.

Will try to get this merged into seqrepo, alternatively can branch or build on top of it to implement this.

Lingua principale
Python
Stelle
63
Fork
43
Merge medio
1h 2m
PR unite (30g)
1

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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