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Graceful error handling in future_lapply

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
distributed-systems

Direzione di ricerca

Partire dalla chiamata a future_lapply e dal percorso values(fs) descritto nel report, quindi tracciare come viene gestito FutureError quando la connessione a un nodo del cluster non riesce. Done deve essere definito come un comportamento chiaro per i singoli nodi che falliscono, mantenendo i risultati dei nodi che completano l’operazione; il comportamento deve essere documentato o esposto tramite l’interfaccia di gestione degli errori richiesta.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

feature request

I've been using future_lapply to submit jobs to a cluster of gcloud compute nodes - which is awesome!! Thanks so much for adding this user-friendly function.

One issue I'm running into, however, concerns the behavior when one of my gcloud compute nodes goes down unexpectedly.

Here's what I see:

Error in unserialize(node$con) :
  Failed to retrieve the value of ClusterFuture from cluster node #1 (on ‘35.190.151.35’).  The reason reported was ‘error reading from connection’
Calls: future_lapply ... FutureRegistry -> collectValues -> value -> value.ClusterFuture
Execution halted

Is there a good way to catch these errors for individual nodes, so that I can still access results from the nodes which are still executing? IE, can we pass an on.error function to call to values(fs)?

For now I have wrapped these in a call to withCallingHandlers() to catch & ignore this error. I haven't tested it in a real-life situation, but assuming it works this may be something to include in your vignette Common Issues with Solutions.

The code currently looks like something the following:

withCallingHandlers({
    remote_jobs <- future_lapply(seq_len(num_data_sims),
                                 execute_simtest,
                                 future.seed = 0xBEEF,
                                 future.scheduling = 2
                                 )
    }, FutureError = function(e) NULL
)
Lingua principale
R
Stelle
218
Fork
20
Merge medio
2g 9h
PR unite (30g)
1

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
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