Process/Decode Chunk Issue

Aperta
#419 5 commenti 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python

Direzione di ricerca

Riproducete il malfunzionamento utilizzando i riferimenti Kerchunk forniti e i metadati .zarray yyyymmdd. Tracciate il modo in cui il valore del chunk viene decodificato e rimodellato, quindi verificate che la rappresentazione venga interpretata in modo coerente con la forma dichiarata [3600,64] e la dimensione del chunk [1,64], producendo il risultato atteso di 1 per 64.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

I have some NetCDF UKCP data with a variable called "yyyymmdd" that is stored in the Kerchunk file like so:

"yyyymmdd/.zarray": "{\"chunks\":[1,64],\"compressor\":null,\"dtype\":\"|S1\",\"fill_value\":\"IA==\",\"filters\":null,\"order\":\"C\",\"shape\":[3600,64],\"zarr_format\":2}",
        "yyyymmdd/.zattrs": "{\"_ARRAY_DIMENSIONS\":[\"time\",\"string64\"],\"long_name\":\"yyyymmdd\",\"units\":\"1\"}",
        "yyyymmdd/0.0": "19801201",
        "yyyymmdd/1.0": "19801202",
        "yyyymmdd/2.0": "19801203",
        "yyyymmdd/3.0": "19801204",
        "yyyymmdd/4.0": "19801205",
        "yyyymmdd/5.0": "19801206",
        "yyyymmdd/6.0": "19801207",
        "yyyymmdd/7.0": "19801208",
        "yyyymmdd/8.0": "19801209",
        "yyyymmdd/9.0": "19801210",

When decoded I get the error message:
cannot reshape array of size 8 into shape (1,64)

Which I think is because the part of Zarr that decodes this is expecting a base64 encoded array rather than a string of 8 characters? That or the dimension/chunk/shape is being interpreted incorrectly. How should an array like this be interpreted within Zarr and decoded into an array of 1 by 64 when each chunk is an 8 character string?

Lingua principale
Python
Stelle
367
Fork
97
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di fsspec/kerchunk

Tutte le issue di fsspec/kerchunk

Issue simili

Altre issue su Python

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.