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Allow different types of species and reaction at surface

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
backend

Direzione di ricerca

Inizia leggendo gli entry point esistenti di SurfaceReactionBC, Species e GasSpecies e il caso Depleting Source collegato nell’issue. Ricostruisci come vengono gestiti attualmente reagenti, prodotti, pressioni e flussi prima di definire i parametri aggiuntivi di confinamento. Il lavoro è completato quando specie gassose e adsorbite miste funzionano in entrambe le direzioni della reazione e le pressioni calcolate dinamicamente sono supportate e coperte dai test.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement fenicsx

We would need to support surface reactions of the type:

A + B <-> C + D

Where both sides of the reaction can have gaseous or adsorbed species.

For example

T (ad) + H2O (g) <-> H (ad) + HTO (g)

import festim as F


T = F.Species("T")
H2O = F.GasSpecies("H2O", pressure=lambda t: 1e5 + t)
HTO = F.GasSpecies("HTO", dynamically_computed=True)
H = F.Species("H")

my_reaction = F.SurfaceReactionBC(
    reactant=[H2O, T],
    product=[HTO, H],
    k_r0=1e-6,
    E_kr=0.2,
    k_d0=1e-6,
    E_kd=0.2,
)

Assuming both rates $K$ and units are #/m2/s/(#/m-3)/Pa are equal, the fluxes are:

$$
J_T = K c_H P_{HTO} - K c_T P_{H2O}
$$

$$
J_H = K c_T P_{H2O} - K c_H P_{HTO}
$$

The flag dynamically_computed could be a way to simulate enclosures as in the Depleting Source case where the partial pressure of that species is dynamically computed from the flux. Although we would need additional parameters like surface area, volume of the enclosure, etc

Lingua principale
Python
Stelle
136
Fork
47
Merge medio
4g 35m
PR unite (30g)
11

Preparare l'ambiente

  • Nessun Dockerfile né file Docker Compose
  • Ha un modello di pull request
  • Nessuna guida per i contributori

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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