test_reextract_metadata some times times out on NFS

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Descrizione

dandi@drogon:/mnt/backup/dandi/tinuous-logs/dandi-cli/2024/09$ git grep 'test_reextract_metadata - Failed: Timeout'
09/github/push/master/8e0b1c3/Tests/5813/17_test (ubuntu-latest, 3.8, nfs).txt:2024-09-09T18:34:27.1037493Z FAILED dandi/cli/tests/test_service_scripts.py::test_reextract_metadata - Failed: Timeout >300.0s
09/github/push/master/8e0b1c3/Tests/5813/test (ubuntu-latest, 3.8, nfs)/8_Run all tests.txt:2024-09-09T18:34:27.1037478Z FAILED dandi/cli/tests/test_service_scripts.py::test_reextract_metadata - Failed: Timeout >300.0s
13/github/cron/20240913T060423/9580513/Tests/5823/17_test (ubuntu-latest, 3.8, nfs).txt:2024-09-13T06:25:22.3331933Z FAILED dandi/cli/tests/test_service_scripts.py::test_reextract_metadata - Failed: Timeout >300.0s
13/github/cron/20240913T060423/9580513/Tests/5823/test (ubuntu-latest, 3.8, nfs)/8_Run all tests.txt:2024-09-13T06:25:22.3331928Z FAILED dandi/cli/tests/test_service_scripts.py::test_reextract_metadata - Failed: Timeout >300.0s
13/github/pr/1497/8dba010/Tests/5824/17_test (ubuntu-latest, 3.8, nfs).txt:2024-09-13T14:26:35.3974202Z FAILED dandi/cli/tests/test_service_scripts.py::test_reextract_metadata - Failed: Timeout >300.0s
13/github/pr/1497/8dba010/Tests/5824/test (ubuntu-latest, 3.8, nfs)/8_Run all tests.txt:2024-09-13T14:26:35.3974196Z FAILED dandi/cli/tests/test_service_scripts.py::test_reextract_metadata - Failed: Timeout >300.0s

Preparare l'ambiente

Come iniziare

1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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• pynwb metadata: get neurodata types

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  dandi/dandi-cli#611 · Aperta il 4/5/2021

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• `metadata.nwb.get_metadata()` validates the whole BIDS dataset for every NWB file, then discards the result

  Forse già presa @CodyCBakerPhD l’ha presa 5 giorni fa. Aperta

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  BIDS performance

  dandi/dandi-cli#1962 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 13/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• `bids_version` is always `None` since the switch to bids-validator-deno

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  BIDS bug

  Difficoltà 3/5 Mezza giornata Idoneità per principianti 45/100

  dandi/dandi-cli#1961 · 4 commenti · Aperta il 13/10/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Support NWB files stored as Zarr (`.nwb.zarr`)

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  Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

  dandi/dandi-cli#1920 · 2 commenti · Aperta il 10/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

• Zarr depth limit rejects NWB chunk paths

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  dandi/dandi-cli#1919 · Aperta il 10/9/2026

  I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

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