Proprietario
catalystneuro
24 repository indicizzati · Vedi su GitHub
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neuroconv
Create NWB files by converting and combining neural data in proprietary formats and adding essential metadata.
Python · 81 stelle
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roiextractors
Python-based module for extracting from, converting between, and handling optical imaging data from several file formats. Inspired by Spi...
Python · 18 stelle
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ndx-fiber-photometry
This is an NWB extension for storing fiber photometry recordings and associated metadata.
Python · 5 stelle
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zarr-matlab
Read and write Zarr v3 natively in MATLAB — full codec support (zstd, blosc, gzip, crc32c), sharding, and byte-level interop with zarr-py...
MATLAB · 4 stelle
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claude-skills
Public repository of skills for neurophysiology research
Python · 3 stelle
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nwb-video-widgets
Interactive Jupyter widgets for playing synchronized videos and visualizing pose estimation data from NWB files (local and DANDI)
Python · 2 stelle
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Python · 2 stelle
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Python · 1 stella
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ndx-ophys-devices
This is an NWB extension for storing metadata of devices used in optical experimental setup (microscopy, fiber photometry, optogenetic st...
Python · 1 stella
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ndx-sound
NWB extension of sounds
Python · 1 stella
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hdmf-zarr-matlab
hdmf-zarr storage conventions (links, references) for MATLAB — NWB-Zarr support on zarr-matlab
MATLAB · 0 stelle
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hanks-lab-to-nwb
Conversion of fiber photometry and behavioral data from the Hanks lab (UC Davis) to NWB. Part of the SFARI Autism Rat Models Consortium ...
Jupyter Notebook · 0 stelle
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Python · 0 stelle
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Jupyter Notebook · 0 stelle
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.github
Company-wide documentation of practices, protocols, policies, and processes.
0 stelle
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ndx-spikesorting
NWB extension to store spike sorting outputs and extensions
Python · 0 stelle
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hnasko-lab-to-nwb
NWB Conversion project for the Hnasko Lab
Jupyter Notebook · 0 stelle
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IBL-mesoscope-to-nwb
NWB Conversion project for IBL mesoscope dataset
Jupyter Notebook · 0 stelle
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IBL-fiberphotometry-to-nwb
NWB Conversion project for IBL fiber photometry dataset
Jupyter Notebook · 0 stelle
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IBL-widefield-to-nwb
NWB Conversion project for the IBL widefield dataset
Jupyter Notebook · 0 stelle
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Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 70/100
catalystneuro/neuroconv#2078 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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[Feature]: Support Zarr v3Apertaenhancement
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
catalystneuro/neuroconv#2076 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100
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bug
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 69/100
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enhancement
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 85/100
catalystneuro/zarr-matlab#29 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 74/100
catalystneuro/zarr-matlab#28 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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bug
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
catalystneuro/zarr-matlab#27 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 68/100
catalystneuro/zarr-matlab#26 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100
catalystneuro/zarr-matlab#25 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 86/100
catalystneuro/zarr-matlab#23 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 74/100
catalystneuro/zarr-matlab#21 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 76/100
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enhancement
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 78/100
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bug
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 78/100
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Improve Bpod event namesAperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 58/100
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100
catalystneuro/find_reuse#55 · 2 commenti ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
catalystneuro/find_reuse#52 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100
catalystneuro/neuroconv#2060 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Fable 5.1 suggestions
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
catalystneuro/neuroconv#2034 · 3 commenti ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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bug fiber photometry time_alignment
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 74/100
catalystneuro/neuroconv#1994 · 1 commento · 2 reazioni ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
catalystneuro/find_reuse#21 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
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metadata
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
catalystneuro/neuroconv#1802 · 7 commenti ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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`DoricFiberPhotometryInterface`: warn on gaps and add optional NaN-padding for uniform-rate outputAperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 55/100
catalystneuro/neuroconv#1791 · 4 commenti ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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[Feature]: HERD integrationForse di nuovo libera @alessandratrapani l’ha presa 60 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Apertaenhancement ontology annotations
catalystneuro/neuroconv#1771 · 7 commenti · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Kilosort templates not added to NWBForse di nuovo libera @h-mayorquin l’ha presa 106 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Apertaecephys enhancement
catalystneuro/neuroconv#1762 · 4 commenti · 1 assegnatario ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
catalystneuro/ndx-fiber-photometry#54 · 5 commenti ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 38/100
catalystneuro/roiextractors#582 ·
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Provide a unified metadata API on imaging extractorsForse di nuovo libera @h-mayorquin l’ha presa 156 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
catalystneuro/roiextractors#578 · 6 commenti · 1 assegnatario ·
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[Improvements] nwb-convert skill improvements after hands-on use across multiple conversion projectsForse di nuovo libera @alessandratrapani l’ha presa 166 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
catalystneuro/claude-skills#14 · 2 commenti · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 42/100
catalystneuro/neuroconv#1715 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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Multiple videos per cameraAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
catalystneuro/nwb-video-widgets#34 · 3 commenti ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100
catalystneuro/nwb-video-widgets#30 · 2 commenti ·
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Notes from 24th Feb MeetingAperta
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
catalystneuro/ndx-spikesorting#4 · 1 reazione ·
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Templates storage designAperta
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
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Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100
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IBL fiber photometry Conversion Project ProgressForse di nuovo libera @alessandratrapani l’ha presa 258 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
catalystneuro/IBL-fiberphotometry-to-nwb#3 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 32/100
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[New Format]: LabChart7Apertadata interfaces enhancement
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
catalystneuro/neuroconv#1623 · 1 commento ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
catalystneuro/neuroconv#1618 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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[Feature]: spike2 supportApertaenhancement
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100
catalystneuro/neuroconv#1586 · 2 commenti ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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enhancement ophys
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100
catalystneuro/neuroconv#1536 · 1 commento · 3 reazioni ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
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IBL widefield Conversion Project ProgressForse di nuovo libera @alessandratrapani l’ha presa 377 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
catalystneuro/IBL-widefield-to-nwb#2 · 1 commento · 1 assegnatario ·
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IBL mesoscope Conversion Project ProgressForse di nuovo libera @alessandratrapani l’ha presa 377 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
catalystneuro/IBL-mesoscope-to-nwb#2 · 1 assegnatario ·
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Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100
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