Output compression robot name in shotgun prep sheet?

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#508 aperta il 9/5/2019 1 commento 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

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Valutazione

Difficoltà: 3/5
Tempo stimato: 1-2 giorni
Idoneità per principianti: 35/100

Tipo di issue: Funzionalità
Chiarezza: Abbastanza chiara
Stato di attività: Ferma
Stack tecnologico: python
Ambito: backend

Direzione di ricerca

Inizia individuando il codice che genera gli output delle schede di preparazione amplicon e shotgun, quindi confronta il modo in cui vengono raccolte le informazioni sui robot per ciascun processo. Controlla come LabControl registra il robot della fase di compressione e determina dove dovrebbe comparire nell’output shotgun. Il lavoro è completato quando la scheda di preparazione shotgun include queste informazioni sul robot senza modificare l’output amplicon.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement priority:low question

The amplicon prep sheet includes info on the robots used for various steps of the sample handling. The shotgun process includes a compression step (which the amplicon process does not) for which LabControl records the robot used (see screenshot) ... should this be included in the shotgun prep sheet output?

shotgun prep sheet could output compression robot

Lingua principale: Python
Stelle: 2
Fork: 15
Metriche di merge delle PR: Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

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Come iniziare

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