TheAxonLab: progetti open source

Compute FC from the atlas projected on the surface Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#531 · Aperta il 3/6/2025

Modify standard protocol schedule according last minute changes Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

TheAxonLab/hcph-sops#503 · Aperta il 2/9/2024

Mislabeled scanner rooms Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 75/100

TheAxonLab/hcph-sops#482 · Aperta il 18/8/2024

Set up EyeLink and PyEdfRead in 2024 Aperta

eye-tracking

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 48/100

TheAxonLab/hcph-sops#481 · 2 commenti · Aperta il 19/6/2024

A snippet for directly writing the dataframe "recording" and metadata into BIDS format Aperta

eye-tracking

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 38/100

TheAxonLab/hcph-sops#480 · 1 reazione · Aperta il 19/6/2024

Plot the ratings in relation to the IQMs or PCA components to see if there are clear patterns Aperta

TheAxonLab/hcph-sops#474 · 1 assegnatario · Aperta il 30/4/2024

[EDF to BIDS conversion] clean up obsolete commented lines of `eyetrackingrun.py` and make sure code snippets in `edf_to_bids.md` match `eyetrackingrun.py` Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 55/100

TheAxonLab/hcph-sops#458 · Aperta il 26/3/2024

[EDF to BIDS revision] Clarify extraction of validation information from eye-tracking data Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#457 · Aperta il 26/3/2024

[EDF to BIDS revision] Unclear explanation about how to extract `Startime` and `Stoptime` metadata Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#456 · 1 reazione · Aperta il 26/3/2024

[EDF to BIDS revision] Add code snippet about how to call the script for EDF to BIDS conversion Aperta

documentation

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 55/100

TheAxonLab/hcph-sops#455 · 2 reazioni · Aperta il 26/3/2024

Define fMRIPrep output space Aperta

documentation QC criteria

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#454 · Aperta il 13/3/2024

Define what means for susceptibility distortion to be large Aperta

documentation QC criteria

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#453 · Aperta il 13/3/2024

Add QC criteria for T2w anatomical Aperta

documentation QC criteria

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

TheAxonLab/hcph-sops#452 · Aperta il 13/3/2024

Modify FC to be computed from surfaces Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#451 · Aperta il 13/3/2024

Write SOP for clinical acquisition Aperta

documentation

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

TheAxonLab/hcph-sops#450 · Aperta il 11/3/2024

Add SIMON dataset in Table 2 Aperta

manuscript

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 40/100

TheAxonLab/hcph-sops#449 · Aperta il 11/3/2024

Add CNeuroMod dataset in Table 2 Aperta

manuscript

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#448 · Aperta il 11/3/2024

[Manuscript] Adapt Table 3 and Table 4 as we will acquire multi-echo on the clinical scanner as well Aperta

manuscript

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 15/100

TheAxonLab/hcph-sops#447 · Aperta il 11/3/2024

Should we remove the "Extended reports shared across echos" section of the MRIQC report? Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#446 · Aperta il 11/3/2024

Exclusion criteria missing for T2* GM values of fMRIPrep visual report Aperta

QC criteria

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#443 · Aperta il 6/2/2024

Exclusion criteria missing for T2* map of fMRIPrep visual report Aperta

QC criteria

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

TheAxonLab/hcph-sops#442 · Aperta il 6/2/2024

Exclusion criteria missing for anatomical conformation section of fMRIPrep visual report Aperta

documentation QC criteria

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#441 · Aperta il 6/2/2024

Allow to tweak confounds regressed for FC extraction Aperta

TheAxonLab/hcph-sops#438 · 1 assegnatario · Aperta il 5/2/2024

We could be more explicit about how to set the calibrations points for GA calibration Aperta

documentation

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 48/100

TheAxonLab/hcph-sops#432 · 1 reazione · Aperta il 26/1/2024

Testing the synchronization server : what output corresponds to a successful installation? Aperta

documentation

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#431 · Aperta il 26/1/2024

Clarification needed about Dropbox configuration Aperta

documentation

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

TheAxonLab/hcph-sops#430 · Aperta il 26/1/2024

Missing information in creating the AcqKnowledge's template graph file Aperta

bug documentation

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 30/100

TheAxonLab/hcph-sops#429 · 1 commento · Aperta il 26/1/2024

BUG: Overlenient parsing of *Psychopy*'s log inserting offset in events file Aperta

bug

TheAxonLab/hcph-sops#427 · 1 assegnatario · Aperta il 25/1/2024

Move FC report generation to nireports Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

TheAxonLab/hcph-sops#422 · 1 commento · Aperta il 19/1/2024

Error in description of the NSD dataset (Table 2). Aperta

manuscript

TheAxonLab/hcph-sops#420 · 1 assegnatario · Aperta il 18/1/2024

DWI MRIQC report were not generated Aperta

mriqc

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#418 · 2 commenti · Aperta il 15/1/2024

Running fMRIPrep roadmap Aperta

fmriprep

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

TheAxonLab/hcph-sops#417 · Aperta il 15/1/2024

Units of the respiration belt Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#409 · 7 commenti · Aperta il 5/12/2023

Cannot run ses-048 and ses-041 through fMRIPrep Aperta

bug data(lad) fmriprep

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#396 · 4 commenti · Aperta il 23/11/2023

Exclusion criteria for sudden movement during dMRI related to sleep Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

TheAxonLab/hcph-sops#391 · Aperta il 23/11/2023

`_eyetrack.json` wrongly define `StartTime` and `StopTime` Aperta

eye-tracking

TheAxonLab/hcph-sops#354 · 4 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 9/11/2023

Write physio QC procedures and criteria Aperta

documentation physio

TheAxonLab/hcph-sops#349 · 1 assegnatario · Aperta il 8/11/2023

ET: Convert all sessions to BIDS Aperta

eye-tracking

TheAxonLab/hcph-sops#345 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 8/11/2023

Create a Jupyter notebook demonstrating ET conversion into BIDS Aperta

eye-tracking urgent

TheAxonLab/hcph-sops#344 · 1 assegnatario · Aperta il 8/11/2023

Include ET "messages" within the BIDS distribution of the dataset Aperta

eye-tracking

TheAxonLab/hcph-sops#341 · 1 assegnatario · Aperta il 7/11/2023

Consider unit tests on code generating events files and physio Aperta

TheAxonLab/hcph-sops#339 · 1 assegnatario · Aperta il 7/11/2023

Deep revision of physio of session 4 Aperta

TheAxonLab/hcph-sops#325 · 1 assegnatario · Aperta il 1/11/2023

Convert physio to BIDS - sessions 11 and 13 Aperta

TheAxonLab/hcph-sops#324 · 1 assegnatario · Aperta il 1/11/2023

Get the MR helium level as described in the SOP Aperta

TheAxonLab/hcph-sops#259 · 5 commenti · 1 reazione · 1 assegnatario · Aperta il 17/10/2023

We should verify ManufacturersModelName, DeviceSerialNumber, and SoftwareVersion on the ET computer during the next scanning session Aperta

eye-tracking urgent

TheAxonLab/hcph-sops#238 · 10 commenti · 2 assegnatari · Aperta il 11/10/2023

BIDS names of eye-tracking data do not follow the eye-tracking BEP Aperta

eye-tracking urgent

TheAxonLab/hcph-sops#235 · 1 assegnatario · Aperta il 11/10/2023

NaN value in ET data must be replaced by ``n/a`` Aperta

eye-tracking urgent

TheAxonLab/hcph-sops#233 · 1 assegnatario · Aperta il 10/10/2023

Load functional atlas using *TemplateFlow* Aperta

enhancement

TheAxonLab/hcph-sops#212 · 1 assegnatario · Aperta il 27/9/2023

Functional connectivity roadmap Aperta

enhancement

TheAxonLab/hcph-sops#208 · 1 assegnatario · Aperta il 26/9/2023

Use rapidtide to fix potential inflation in FC Aperta

enhancement

TheAxonLab/hcph-sops#207 · 5 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 26/9/2023

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