TheAxonLab: proyectos de código abierto

Compute FC from the atlas projected on the surface Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#531 · Abierto el 3/6/2025

Modify standard protocol schedule according last minute changes Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

TheAxonLab/hcph-sops#503 · Abierto el 2/9/2024

Mislabeled scanner rooms Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 75/100

TheAxonLab/hcph-sops#482 · Abierto el 18/8/2024

Set up EyeLink and PyEdfRead in 2024 Abierto

eye-tracking

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 48/100

TheAxonLab/hcph-sops#481 · 2 comentarios · Abierto el 19/6/2024

A snippet for directly writing the dataframe "recording" and metadata into BIDS format Abierto

eye-tracking

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 38/100

TheAxonLab/hcph-sops#480 · 1 reacción · Abierto el 19/6/2024

Plot the ratings in relation to the IQMs or PCA components to see if there are clear patterns Abierto

TheAxonLab/hcph-sops#474 · 1 asignado · Abierto el 30/4/2024

[EDF to BIDS conversion] clean up obsolete commented lines of `eyetrackingrun.py` and make sure code snippets in `edf_to_bids.md` match `eyetrackingrun.py` Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

TheAxonLab/hcph-sops#458 · Abierto el 26/3/2024

[EDF to BIDS revision] Clarify extraction of validation information from eye-tracking data Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#457 · Abierto el 26/3/2024

[EDF to BIDS revision] Unclear explanation about how to extract `Startime` and `Stoptime` metadata Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#456 · 1 reacción · Abierto el 26/3/2024

[EDF to BIDS revision] Add code snippet about how to call the script for EDF to BIDS conversion Abierto

documentation

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 55/100

TheAxonLab/hcph-sops#455 · 2 reacciones · Abierto el 26/3/2024

Define fMRIPrep output space Abierto

documentation QC criteria

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#454 · Abierto el 13/3/2024

Define what means for susceptibility distortion to be large Abierto

documentation QC criteria

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#453 · Abierto el 13/3/2024

Add QC criteria for T2w anatomical Abierto

documentation QC criteria

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 30/100

TheAxonLab/hcph-sops#452 · Abierto el 13/3/2024

Modify FC to be computed from surfaces Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#451 · Abierto el 13/3/2024

Write SOP for clinical acquisition Abierto

documentation

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

TheAxonLab/hcph-sops#450 · Abierto el 11/3/2024

Add SIMON dataset in Table 2 Abierto

manuscript

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 40/100

TheAxonLab/hcph-sops#449 · Abierto el 11/3/2024

Add CNeuroMod dataset in Table 2 Abierto

manuscript

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#448 · Abierto el 11/3/2024

[Manuscript] Adapt Table 3 and Table 4 as we will acquire multi-echo on the clinical scanner as well Abierto

manuscript

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 15/100

TheAxonLab/hcph-sops#447 · Abierto el 11/3/2024

Should we remove the "Extended reports shared across echos" section of the MRIQC report? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#446 · Abierto el 11/3/2024

Exclusion criteria missing for T2* GM values of fMRIPrep visual report Abierto

QC criteria

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#443 · Abierto el 6/2/2024

Exclusion criteria missing for T2* map of fMRIPrep visual report Abierto

QC criteria

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 30/100

TheAxonLab/hcph-sops#442 · Abierto el 6/2/2024

Exclusion criteria missing for anatomical conformation section of fMRIPrep visual report Abierto

documentation QC criteria

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#441 · Abierto el 6/2/2024

Allow to tweak confounds regressed for FC extraction Abierto

TheAxonLab/hcph-sops#438 · 1 asignado · Abierto el 5/2/2024

We could be more explicit about how to set the calibrations points for GA calibration Abierto

documentation

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 48/100

TheAxonLab/hcph-sops#432 · 1 reacción · Abierto el 26/1/2024

Testing the synchronization server : what output corresponds to a successful installation? Abierto

documentation

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

TheAxonLab/hcph-sops#431 · Abierto el 26/1/2024

Clarification needed about Dropbox configuration Abierto

documentation

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

TheAxonLab/hcph-sops#430 · Abierto el 26/1/2024

Missing information in creating the AcqKnowledge's template graph file Abierto

bug documentation

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 30/100

TheAxonLab/hcph-sops#429 · 1 comentario · Abierto el 26/1/2024

BUG: Overlenient parsing of *Psychopy*'s log inserting offset in events file Abierto

bug

TheAxonLab/hcph-sops#427 · 1 asignado · Abierto el 25/1/2024

Move FC report generation to nireports Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

TheAxonLab/hcph-sops#422 · 1 comentario · Abierto el 19/1/2024

Error in description of the NSD dataset (Table 2). Abierto

manuscript

TheAxonLab/hcph-sops#420 · 1 asignado · Abierto el 18/1/2024

DWI MRIQC report were not generated Abierto

mriqc

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#418 · 2 comentarios · Abierto el 15/1/2024

Running fMRIPrep roadmap Abierto

fmriprep

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

TheAxonLab/hcph-sops#417 · Abierto el 15/1/2024

Units of the respiration belt Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#409 · 7 comentarios · Abierto el 5/12/2023

Cannot run ses-048 and ses-041 through fMRIPrep Abierto

bug data(lad) fmriprep

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

TheAxonLab/hcph-sops#396 · 4 comentarios · Abierto el 23/11/2023

Exclusion criteria for sudden movement during dMRI related to sleep Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

TheAxonLab/hcph-sops#391 · Abierto el 23/11/2023

`_eyetrack.json` wrongly define `StartTime` and `StopTime` Abierto

eye-tracking

TheAxonLab/hcph-sops#354 · 4 comentarios · 1 asignado · Abierto el 9/11/2023

Write physio QC procedures and criteria Abierto

documentation physio

TheAxonLab/hcph-sops#349 · 1 asignado · Abierto el 8/11/2023

ET: Convert all sessions to BIDS Abierto

eye-tracking

TheAxonLab/hcph-sops#345 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 8/11/2023

Create a Jupyter notebook demonstrating ET conversion into BIDS Abierto

eye-tracking urgent

TheAxonLab/hcph-sops#344 · 1 asignado · Abierto el 8/11/2023

Include ET "messages" within the BIDS distribution of the dataset Abierto

eye-tracking

TheAxonLab/hcph-sops#341 · 1 asignado · Abierto el 7/11/2023

Consider unit tests on code generating events files and physio Abierto

TheAxonLab/hcph-sops#339 · 1 asignado · Abierto el 7/11/2023

Deep revision of physio of session 4 Abierto

TheAxonLab/hcph-sops#325 · 1 asignado · Abierto el 1/11/2023

Convert physio to BIDS - sessions 11 and 13 Abierto

TheAxonLab/hcph-sops#324 · 1 asignado · Abierto el 1/11/2023

Get the MR helium level as described in the SOP Abierto

TheAxonLab/hcph-sops#259 · 5 comentarios · 1 reacción · 1 asignado · Abierto el 17/10/2023

We should verify ManufacturersModelName, DeviceSerialNumber, and SoftwareVersion on the ET computer during the next scanning session Abierto

eye-tracking urgent

TheAxonLab/hcph-sops#238 · 10 comentarios · 2 asignados · Abierto el 11/10/2023

BIDS names of eye-tracking data do not follow the eye-tracking BEP Abierto

eye-tracking urgent

TheAxonLab/hcph-sops#235 · 1 asignado · Abierto el 11/10/2023

NaN value in ET data must be replaced by ``n/a`` Abierto

eye-tracking urgent

TheAxonLab/hcph-sops#233 · 1 asignado · Abierto el 10/10/2023

Load functional atlas using *TemplateFlow* Abierto

enhancement

TheAxonLab/hcph-sops#212 · 1 asignado · Abierto el 27/9/2023

Functional connectivity roadmap Abierto

enhancement

TheAxonLab/hcph-sops#208 · 1 asignado · Abierto el 26/9/2023

Use rapidtide to fix potential inflation in FC Abierto

enhancement

TheAxonLab/hcph-sops#207 · 5 comentarios · 1 asignado · Abierto el 26/9/2023

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