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Integration with NWB

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Tranquilla
Stack tecnologico
python
Ambito
data

Direzione di ricerca

Start by comparing the ndx-franklab-novela repository with src/spec/create_extension_spec.py in ndx-spatial-coordinates, then review how this package represents probe geometry and wiring. Document whether the NWB projects overlap and define the scope of an official probe description integration; the relationship and proposed direction should be clear to users.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement

@lfrank @bendichter

You both mention NWB backend for handling probe geometry description.
I have NOT studied then yet.
I will.

Are theses two codes linked somehow ?

https://github.com/NovelaNeuro/ndx-franklab-novela
this seams to be a description of in house data management for recordings that also include probes description (with multi shank)

https://github.com/catalystneuro/ndx-spatial-coordinates/blob/main/src/spec/create_extension_spec.py
being unfamilir wuth nwb I get the purposed on this, could you explain more ?

Would be a way to define some kind of offcial to describe probes in NWB.
Maybe my question is naive because I am not aware of what have already been done.

Lingua principale
Python
Stelle
86
Fork
49
Merge medio
9h 43m
PR unite (30g)
2

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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