Make structural analysis settings configurable in RelativeHybridTopologyProtocol

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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
55/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Attiva
Stack tecnologico
python

Direzione di ricerca

Start with the RelativeHybridTopologyProtocol settings and compare them with the analysis_settings already used by the SepTop and ABFE protocols, which show how protein selection and frame stride are exposed. Add the same options to the RBFE protocol, then update the 'not configurable' statement in relativehybridtopology.rst. Done when the settings are accepted and used in the analysis, and the docs describe them.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

The RelativeHybridTopologyProtocol currently does not expose settings to configure the protein selection or frame stride used for structural analysis.

SepTop and ABFE protocols already support these options through their analysis_settings.

After adding the settings to the RBFE protocol, we should update the docs that currently state that it's not configurable (relativehybridtopology.rst).

Lingua principale
Python
Stelle
347
Fork
61
Merge medio
3g 7h
PR unite (30g)
28

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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