Add validation for double to triple bond mappings in RBFE

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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Attiva
Stack tecnologico
python
Ambito
backend

Direzione di ricerca

Read the validation being added in pull request #2270 and check how it handles single-to-triple bond mappings. Then determine whether double-to-triple mappings should also be rejected as unstable; the issue notes that openfe-benchmarks has no example of this transformation. Done means deciding and implementing whether this mapping type receives validation.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

We are adding single to triple bond mapping validation in https://github.com/OpenFreeEnergy/openfe/pull/2270 as this leads to unstable simulations, but we are not sure if we should extend this to cover double to triple mappings as well. I have checked all of the mappings in openfe-benchmarks and we don't seem to have an example of this transformation type.

Lingua principale
Python
Stelle
347
Fork
61
Merge medio
3g 7h
PR unite (30g)
28

Preparare l'ambiente

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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