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Configuring Broadsea WebAPI

Aperta
#2,306 1 commento 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
docker, docker-compose, java

Direzione di ricerca

Inizia riproducendo il comando docker compose segnalato con i profili WebAPI, Atlas, database e driver elencati, quindi esamina la configurazione Compose e i log ripetuti di starschema. Determina quale servizio o dipendenza impedisce il completamento dell'avvio. Il lavoro è completato quando il container WebAPI si avvia in modo affidabile, il server previsto è raggiungibile all'indirizzo http://127.0.0.1/ e starschema non entra più in loop inaspettatamente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Expected behavior

When we run the WebAPI docker container, we expected the server http://127.0.0.1/ to be opened. However, after we pulled the missing drivers (Oracle, Cloudera Impala, Starschema BigQuery, Netezza, simbam1Postgres) in addition to our existing drivers (ohdsi-atlas, broadsea-atlasdb, ohdsi-webapi), and tried to run this command "docker compose pull && docker compose --profile webapi-from-image --profile atlas-from-image --profile atlasdb --profile cloudera_driver --profile starschema_driver --profile oracle_driver --profile netezza_driver --profile apacheHive_driver --profile simbam1Postgres_driver up", the server start running but there is a schema called "starschema" running again and again. But it's not stopping.
#2304


How we can fix the start level of the WebAPI configurations, including the all the docker images that required by the OHDSI/WebAPI ?

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STACK TRACE:

starschema | [20:41:04 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Executed DbCommand (0ms) [Parameters=[@__p_0='?' (Size = 22)], CommandType='Text', CommandTimeout='30']
starschema | SELECT "f"."Name", "f"."Content", "f"."ContentType", "f"."LastUpdated"
starschema | FROM "Files" AS "f"
starschema | WHERE "f"."Name" = @__p_0
starschema | LIMIT 1
starschema | [20:41:04 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Hosted job: 'AppConfigAutoRefresh' completed successfully
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Entity Framework Core 6.0.6 initialized 'SqliteDbContext' using provider 'Microsoft.EntityFrameworkCore.Sqlite:6.0.6' with options: DetailedErrorsEnabled MigrationsHistoryTable=__EFMigrationsHistory
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Executed DbCommand (0ms) [Parameters=[@__p_0='?' (Size = 15)], CommandType='Text', CommandTimeout='30']
starschema | SELECT "f"."Name", "f"."Content", "f"."ContentType", "f"."LastUpdated"
starschema | FROM "Files" AS "f"
starschema | WHERE "f"."Name" = @__p_0
starschema | LIMIT 1
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Entity Framework Core 6.0.6 initialized 'SqliteDbContext' using provider 'Microsoft.EntityFrameworkCore.Sqlite:6.0.6' with options: DetailedErrorsEnabled MigrationsHistoryTable=__EFMigrationsHistory
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Executed DbCommand (0ms) [Parameters=[@__p_0='?' (Size = 22)], CommandType='Text', CommandTimeout='30']
starschema | SELECT "f"."Name", "f"."Content", "f"."ContentType", "f"."LastUpdated"
starschema | FROM "Files" AS "f"
starschema | WHERE "f"."Name" = @__p_0
starschema | LIMIT 1
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Hosted job: 'AppConfigAutoRefresh' completed successfully

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Lingua principale
Java
Stelle
153
Fork
187
Merge medio
2g 12h
PR unite (30g)
13

Preparare l'ambiente

  • Include un Dockerfile o un file Docker Compose
  • Nessun modello di pull request
  • Nessuna guida per i contributori

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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