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Configuring Broadsea WebAPI

Abierto
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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
docker, docker-compose, java

Línea de trabajo

Empieza reproduciendo el comando de docker compose reportado con los perfiles de WebAPI, Atlas, base de datos y controlador indicados; después, inspecciona la configuración de Compose y los logs repetidos de starschema. Determina qué servicio o dependencia impide que se complete el arranque. Se considera terminado cuando el contenedor de WebAPI se inicia de forma fiable, el servidor esperado es accesible en http://127.0.0.1/ y starschema deja de entrar en bucles inesperadamente.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Expected behavior

When we run the WebAPI docker container, we expected the server http://127.0.0.1/ to be opened. However, after we pulled the missing drivers (Oracle, Cloudera Impala, Starschema BigQuery, Netezza, simbam1Postgres) in addition to our existing drivers (ohdsi-atlas, broadsea-atlasdb, ohdsi-webapi), and tried to run this command "docker compose pull && docker compose --profile webapi-from-image --profile atlas-from-image --profile atlasdb --profile cloudera_driver --profile starschema_driver --profile oracle_driver --profile netezza_driver --profile apacheHive_driver --profile simbam1Postgres_driver up", the server start running but there is a schema called "starschema" running again and again. But it's not stopping.
#2304


How we can fix the start level of the WebAPI configurations, including the all the docker images that required by the OHDSI/WebAPI ?

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STACK TRACE:

starschema | [20:41:04 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Executed DbCommand (0ms) [Parameters=[@__p_0='?' (Size = 22)], CommandType='Text', CommandTimeout='30']
starschema | SELECT "f"."Name", "f"."Content", "f"."ContentType", "f"."LastUpdated"
starschema | FROM "Files" AS "f"
starschema | WHERE "f"."Name" = @__p_0
starschema | LIMIT 1
starschema | [20:41:04 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Hosted job: 'AppConfigAutoRefresh' completed successfully
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Entity Framework Core 6.0.6 initialized 'SqliteDbContext' using provider 'Microsoft.EntityFrameworkCore.Sqlite:6.0.6' with options: DetailedErrorsEnabled MigrationsHistoryTable=__EFMigrationsHistory
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Executed DbCommand (0ms) [Parameters=[@__p_0='?' (Size = 15)], CommandType='Text', CommandTimeout='30']
starschema | SELECT "f"."Name", "f"."Content", "f"."ContentType", "f"."LastUpdated"
starschema | FROM "Files" AS "f"
starschema | WHERE "f"."Name" = @__p_0
starschema | LIMIT 1
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Entity Framework Core 6.0.6 initialized 'SqliteDbContext' using provider 'Microsoft.EntityFrameworkCore.Sqlite:6.0.6' with options: DetailedErrorsEnabled MigrationsHistoryTable=__EFMigrationsHistory
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Executed DbCommand (0ms) [Parameters=[@__p_0='?' (Size = 22)], CommandType='Text', CommandTimeout='30']
starschema | SELECT "f"."Name", "f"."Content", "f"."ContentType", "f"."LastUpdated"
starschema | FROM "Files" AS "f"
starschema | WHERE "f"."Name" = @__p_0
starschema | LIMIT 1
starschema | [20:41:14 INF HostedJob 'AppConfigAutoRefresh'] Hosted job: 'AppConfigAutoRefresh' completed successfully

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Lenguaje dominante
Java
Estrellas
153
Forks
186
Merge medio
2 d 12 h
PR fusionados (30 d)
13

Preparar el entorno

  • Incluye un Dockerfile o un archivo de Docker Compose
  • Sin plantilla de pull request
  • Sin guía de contribución

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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