Create model for dissecting the sig field into computable structured data

Aperta
#689 14 commenti 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Ambito
database

Direzione di ricerca

Inizia esaminando i campi proposti nell’issue per sostituire il valore sig in testo libero con dati strutturati sulla frequenza. Non sono indicati file, test o punti di ingresso, quindi il primo passo consiste nell’identificare il modello OMOP CDM pertinente e definire la proposta. Il lavoro è completato quando esiste un modello concordato per rappresentare quantità, unità, frequenza e unità di frequenza, inclusi i valori sig non in inglese.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Drug Dose Discussion

This is a placeholder, so a proposal could be worked out:

Instead of the free text sig field (which may even be in a non-English language), we need to have the actual frequency information. So, 2 mL tablets 3 times a day" would become something like:

sig_amount - numeric (2)
sig_unit_concept_id - concept (concept_id for liquid units, most often "mL")
frequency - numeric (3)
frequency_unit_concept_id - concept (concept_id for "day")

Lingua principale
HTML
Stelle
1.1k
Fork
515
Merge medio
10g 13h
PR unite (30g)
3

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di OHDSI/CommonDataModel

Tutte le issue di OHDSI/CommonDataModel

Issue simili

Altre issue su Databases

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.