Create model for dissecting the sig field into computable structured data

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Evaluación

Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Área
database

Línea de trabajo

Comienza revisando los campos propuestos en el issue para reemplazar el valor sig de texto libre por datos de frecuencia estructurados. No se nombran archivos, pruebas ni puntos de entrada, por lo que el primer paso es identificar el modelo OMOP CDM relevante y concretar la propuesta. Se considera completado cuando exista un modelo acordado para representar cantidad, unidad, frecuencia y unidad de frecuencia, incluidos los valores sig que no estén en inglés.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Drug Dose Discussion

This is a placeholder, so a proposal could be worked out:

Instead of the free text sig field (which may even be in a non-English language), we need to have the actual frequency information. So, 2 mL tablets 3 times a day" would become something like:

sig_amount - numeric (2)
sig_unit_concept_id - concept (concept_id for liquid units, most often "mL")
frequency - numeric (3)
frequency_unit_concept_id - concept (concept_id for "day")

Lenguaje dominante
HTML
Estrellas
1.1k
Forks
515
Merge medio
10 d 13 h
PR fusionados (30 d)
3

Preparar el entorno

Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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