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Vibrations table: ECCE assigns mode symmetry and describes each mode (IR/Raman teaching)

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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Attiva
Stack tecnologico
c
Ambito
desktop, testing

Direzione di ricerca

Start by reading NModePanel.C and tracing the existing symmetry code and normal mode data for the supported chemistry codes. The issue calls for a wx-free analysis library with a command-line test; begin by checking how those modes and point-group operations are represented. Done means symmetry and activity assignments plus internal-coordinate mode descriptions match the listed textbook examples and program output.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

For teaching, the vibration table should say what each IR/Raman peak is. Today it has Frequency, Sym, Infrared and Raman, and Sym is filled only by codes that print mode symmetry: Gaussian and MOPAC. ORCA, NWChem and ECCE-QM print none, so the column shows mode numbers. (The comment in NModePanel.C that says orca.desc extracts VIBSYM is wrong.)

1. Symmetry, for every code

  • Apply the molecule's point-group operations (existing symmetry code) to each mode's displacement vector and read the irrep from the characters.
  • Add IR active / Raman active from the character table, so a mode with no IR intensity is explained.
  • Where the code prints labels as well (Gaussian, MOPAC), the test compares ours with theirs.

2. A Mode column describing the motion

  • Project each normal mode onto internal coordinates (bond stretches, angle bends, out-of-plane bends, torsions) and show the dominant ones with their share, e.g. C=O stretch 86%, H–O–H bend.
  • Equivalent coordinates moving in phase are symmetric, out of phase antisymmetric (O–H stretch, sym. / antisym.).
  • Bond names follow the Builder's bond orders (C=O, C≡N).

Layout: the analysis goes in a wx-free library with a command-line test; the panel only shows the columns.

Checks: textbook assignments for H2O, CO2, NH3, CH4, HCHO and benzene, and the mode descriptions ORCA and NWChem print where they exist.

Codes: every code that gives normal modes (Gaussian 16, ORCA, NWChem, MOPAC, ECCE-QM).

Labels on the plotted peaks are not part of this.

Lingua principale
C
Stelle
10
Fork
8
Merge medio
21m
PR unite (30g)
1

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